arginine-glutamic acid dipeptide (RE) repeats

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

arginine-glutamic acid dipeptide (RE) repeats, Atrophin-1-related protein, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, ATN1L, ARG, KIAA0458, DNB1, RERE, Atrophin-1-like protein, FLJ38775

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:125.60 小脳:138.50 脳幹:- 脳梁:145.80 松果体:296.70 末梢神経:184 脊柱:112.30 網膜:830.50 目:264.50 動脈:119.90 静脈:- リンパ節:364 末梢血:127.50 脾臓:56.70 胸腺:90.20 骨髄:413.30 脂肪:201.70 骨:76.80 皮膚:196.80
GeneChip 大脳:8.02 小脳:8.57 脳幹:7.65 脳梁:7.79 松果体:- 末梢神経:7.66 脊柱:7.63 網膜:- 目:- 動脈:8.40 静脈:8.15 リンパ節:7.99 末梢血:- 脾臓:8.31 胸腺:7.22 骨髄:6.78 脂肪:8.32 骨:- 皮膚:7.99
CAGE 大脳:4.77 小脳:- 脳幹:4.42 脳梁:4.83 松果体:5.55 末梢神経:- 脊柱:4.60 網膜:- 目:- 動脈:4.80 静脈:4.54 リンパ節:4.21 末梢血:- 脾臓:4.34 胸腺:4.08 骨髄:- 脂肪:4.64 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.54 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.22 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.06 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:173.20 胎盤:80.10 前立腺:180.20 卵巣:111.80 精巣:73.50 心臓:191.60 骨格筋:120.50 食道:- 胃:191.20 腸:64.80 結腸:279.80     肝臓:168.90        肺:132    膀胱:- 腎臓:166.40 下垂体:116 甲状腺:491.20 副腎:50.80 膵臓:213.40 乳腺:334.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.79 胎盤:7.56 前立腺:8.98 卵巣:8.61 精巣:8.35 心臓:8.14 骨格筋:8.58 食道:7.90 胃:8.04 腸:7.89 結腸:8.09 肝臓:7.39 肺:7.82 膀胱:- 腎臓:8.64 下垂体:8.27 甲状腺:8.68 副腎:8.39 膵臓:7.01 乳腺:8.60 唾液腺:7.74
CAGE 子宮:5.11 胎盤:4.02 前立腺:4.81 卵巣:4.26 精巣:4.54 心臓:4.78 骨格筋:5.11 食道:4.26 胃:- 腸:4.21 結腸:4.69     肝臓:3.37    肺:4.39 膀胱:4.68 腎臓:4.53 下垂体:4.73 甲状腺:4.48 副腎:- 膵臓:4.38 乳腺:4.56 唾液腺:4.51
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.46 卵巣:2.62 精巣:3.16 心臓:1.73 骨格筋:2.31 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.10     肝臓:0.59        肺:1.77    膀胱:- 腎臓:1.66 下垂体:- 甲状腺:2.66 副腎:2.21 膵臓:- 乳腺:1.64 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001042681
Gene ID 473
Unigene ID Hs.463041
Probe set ID 200940_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000142599
GTEx ID ENSG00000142599

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001085492
ラット [0]  

染色体

1p36.23  [8,412,457  -  8,877,702]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related
IPR001005  SANT, DNA-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9455484
10729226
10814707
11331249
11782456
12107413
12477932
12766061
14645126
14702039
15302935
16303743
16344560
16481466
16710414
16713569
17081983
18029348
18451879
18597038
19131340
19322201
20211142
20379614
20410501
20548946
21139048
21258344
21890473
21926974
22504420
23000965
23453885
23752268

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0006607  NLS-bearing substrate import into nucleus
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0005739  mitochondrion
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0008267  poly-glutamine tract binding
GO:0005515  protein binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008270  zinc ion binding