CCR4-NOT transcription complex, subunit 2

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同義遺伝子名

MSTP046, NOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, CCR4-associated factor 2, CNOT2, CCR4-NOT transcription complex, subunit 2, HSPC131, NOT2H, CDC36

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.91 小脳:8.01 脳幹:6.82 脳梁:7.25 松果体:- 末梢神経:7.11 脊柱:6.96 網膜:- 目:- 動脈:7.94 静脈:7.44 リンパ節:7.92 末梢血:- 脾臓:8 胸腺:8.49 骨髄:7.13 脂肪:7.59 骨:- 皮膚:8.07
CAGE 大脳:4.00 小脳:- 脳幹:3.94 脳梁:3.93 松果体:4.20 末梢神経:- 脊柱:4.06 網膜:- 目:- 動脈:3.82 静脈:3.94 リンパ節:3.91 末梢血:- 脾臓:4.07 胸腺:4.45 骨髄:- 脂肪:4.17 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.59 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.44 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.51 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:7.93 胎盤:7.15 前立腺:7.72 卵巣:7.83 精巣:7.69 心臓:7.37 骨格筋:7.24 食道:7.51 胃:7.52 腸:7.40 結腸:7.11 肝臓:7.35 肺:7.84 膀胱:- 腎臓:7.14 下垂体:7.33 甲状腺:7.74 副腎:7.76 膵臓:6.63 乳腺:8.21 唾液腺:7.04
CAGE 子宮:4.29 胎盤:4.13 前立腺:4.06 卵巣:4.06 精巣:3.77 心臓:3.72 骨格筋:3.76 食道:3.80 胃:- 腸:3.98 結腸:3.64     肝臓:3.68    肺:4.03 膀胱:4.03 腎臓:3.86 下垂体:4.55 甲状腺:3.84 副腎:- 膵臓:3.57 乳腺:3.60 唾液腺:3.95
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.47 卵巣:0.87 精巣:1.76 心臓:0.14 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.09     肝臓:0.24        肺:1.26    膀胱:- 腎臓:0.40 下垂体:- 甲状腺:1.17 副腎:0.96 膵臓:- 乳腺:0.29 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_014515
Gene ID 4848
Unigene ID -
Probe set ID 222182_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000111596
GTEx ID ENSG00000111596

オーソログ対応遺伝子

マウス[13]  NM_001037846, NM_001037847, NM_001037848, NM_028082
ラット[1]  NM_001011988, NM_001037847, NM_001037848, NM_028082

染色体

12q15  [70,636,774  -  70,748,773]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10637334
11042152
12477932
12882519
14702039
14707134
15489334
16039607
16189514
16344560
16712523
16778766
17452450
18377426
19558367
19946888
20211142
20360068
20379614
21299754
21906983
21963094
22367759
22959728
23383273
23602568
24121232
24778252
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0031047  gene silencing by RNA
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0033147  negative regulation of estrogen receptor signaling pathway
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0000289  nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0010606  positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006417  regulation of translation
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0001829  trophectodermal cell differentiation

Cellular Component

GO:0030014  CCR4-NOT complex
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0004535  poly(A)-specific ribonuclease activity
GO:0005515  protein binding