nephronophthisis 1 (juvenile)

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同義遺伝子名

nephronophthisis 1 (juvenile), JBTS4, Juvenile nephronophthisis 1 protein, Nephrocystin-1, NPHP1, NPH1, SLSN1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:9.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:23.50

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:121

骨:12.80

皮膚:-

GeneChip

大脳:3.15

小脳:3.03

脳幹:3.19

脳梁:3.04

松果体:-

末梢神経:2.98

脊柱:3.01

網膜:-

目:-

動脈:3.02

静脈:3.02

リンパ節:2.97

末梢血:-

脾臓:2.94

胸腺:2.90

骨髄:2.98

脂肪:2.96

骨:-

皮膚:2.87

CAGE

大脳:2.44

小脳:-

脳幹:2.17

脳梁:2.47

松果体:2.82

末梢神経:-

脊柱:2.70

網膜:-

目:-

動脈:2.59

静脈:1.49

リンパ節:1.50

末梢血:-

脾臓:1.21

胸腺:0.57

骨髄:-

脂肪:1.93

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.01

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.01

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:108.20

心臓:12.80

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:-

肝臓:10.60

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:26.70

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:2.95

胎盤:2.80

前立腺:2.87

卵巣:2.84

精巣:2.94

心臓:3.20

骨格筋:3.25

食道:2.90

胃:2.98

腸:3.04

結腸:3.16

肝臓:3.06

肺:2.97

膀胱:-

腎臓:3.07

下垂体:3.16

甲状腺:2.95

副腎:3.19

膵臓:3.01

乳腺:2.96

唾液腺:2.94

CAGE

子宮:2.60

胎盤:1.45

前立腺:2.13

卵巣:2.49

精巣:3.85

心臓:2.18

骨格筋:2.21

食道:1.54

胃:-

腸:1.22

結腸:1.65

肝臓:0.71

肺:2.68

膀胱:2.08

腎臓:2.76

下垂体:3.99

甲状腺:2.48

副腎:-

膵臓:2.08

乳腺:1.80

唾液腺:1.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.01

卵巣:0.32

精巣:2.10

心臓:0.00

骨格筋:0.01

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.57

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.48

下垂体:-

甲状腺:0.43

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.50

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000272
Gene ID	4867
Unigene ID	Hs.280388
Probe set ID	206285_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000144061
GTEx ID	ENSG00000144061

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_016902
ラット[1]	NM_001106506

染色体

2q13 [110,879,888 - 110,962,643]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0030036	actin cytoskeleton organization
GO:0030030	cell projection organization
GO:0016337	cell-cell adhesion
GO:0034613	cellular protein localization
GO:0007588	excretion
GO:0060041	retina development in camera-type eye
GO:0007165	signal transduction
GO:0048515	spermatid differentiation
GO:0007632	visual behavior

GO:0005912	adherens junction
GO:0005911	cell-cell junction
GO:0035085	cilium axoneme
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0016020	membrane
GO:0031514	motile secondary cilium
GO:0032391	photoreceptor connecting cilium
GO:0005923	tight junction

GO:0005515	protein binding
GO:0005198	structural molecule activity

nephronophthisis 1 (juvenile)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function