ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, fast twitch 1

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同義遺伝子名

SR Ca(2+)-ATPase 1, Calcium pump 1, SERCA1, Endoplasmic reticulum class 1/2 Ca(2+) ATPase, ATP2A1, ATP2A

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:4.56 小脳:4.42 脳幹:4.53 脳梁:4.44 松果体:- 末梢神経:4.40 脊柱:4.50 網膜:- 目:- 動脈:4.66 静脈:4.82 リンパ節:4.61 末梢血:- 脾臓:4.44 胸腺:4.39 骨髄:4.83 脂肪:4.64 骨:- 皮膚:5.83
CAGE 大脳:0.02 小脳:- 脳幹:0 脳梁:0.07 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:1.57 静脈:3.84 リンパ節:1.90 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:4.00 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.06 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:4.49 胎盤:4.55 前立腺:4.44 卵巣:4.56 精巣:5.05 心臓:4.46 骨格筋:12.18 食道:8.05 胃:4.37 腸:5.78 結腸:4.68 肝臓:4.64 肺:4.48 膀胱:- 腎臓:4.50 下垂体:4.79 甲状腺:4.91 副腎:4.54 膵臓:4.73 乳腺:4.57 唾液腺:4.64
CAGE 子宮:0.16 胎盤:0 前立腺:0.21 卵巣:0 精巣:0.16 心臓:0.11 骨格筋:6.86 食道:3.61 胃:- 腸:0 結腸:0     肝臓:0    肺:0 膀胱:0 腎臓:0 下垂体:0 甲状腺:3.32 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:2.50
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.40 心臓:0.00 骨格筋:7.79 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:6.87 副腎:0.11 膵臓:- 乳腺:6.60 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004320
Gene ID 487
Unigene ID -
Probe set ID 205444_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000196296
GTEx ID ENSG00000196296

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_007504
ラット[1]  NM_007504

染色体

16p11.2  [28,889,804  -  28,915,787]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005782  ATPase, P-type, calcium-transporting
IPR000695  ATPase, P-type, H+ transporting proton pump
IPR001757  ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1329967
1746562
2842876
2936465
8040329
8729696
8825625
8841193
8889548
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9367679
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10551848
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11526231
12032137
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12479237
12525698
12692302
12975374
14638697
14702039
15071553
15718407
15767202
15972723
16192278
16410239
16642550
16754798
16933204
17010426
17110338
17728322
18947188
18953100
19061639
19079260
19644701
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21576492
21726808
21890473
21906983
21963094
22505724
22609207
22939629
23911890
24550385
24639526
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0070059  apoptosis in response to endoplasmic reticulum stress
GO:0008637  apoptotic mitochondrial changes
GO:0006200  ATP catabolic process
GO:0007596  blood coagulation
GO:0070509  calcium ion import
GO:0006816  calcium ion transport
GO:0032470  elevation of endoplasmic reticulum calcium ion concentration
GO:0051561  elevation of mitochondrial calcium ion concentration
GO:0034220  ion transmembrane transport
GO:0051659  maintenance of mitochondrion location
GO:0045988  negative regulation of striated muscle contraction
GO:0031448  positive regulation of fast-twitch skeletal muscle fiber contraction
GO:0032471  reduction of endoplasmic reticulum calcium ion concentration
GO:0006942  regulation of striated muscle contraction
GO:0090076  relaxation of skeletal muscle
GO:0034976  response to endoplasmic reticulum stress
GO:0055085  transmembrane transport

Cellular Component

GO:0034704  calcium channel complex
GO:0005789  endoplasmic reticulum membrane
GO:0005793  ER-Golgi intermediate compartment
GO:0031673  H zone
GO:0031674  I band
GO:0016021  integral to membrane
GO:0016020  membrane
GO:0048471  perinuclear region of cytoplasm
GO:0031095  platelet dense tubular network membrane
GO:0016529  sarcoplasmic reticulum
GO:0033017  sarcoplasmic reticulum membrane

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0005509  calcium ion binding
GO:0005388  calcium-transporting ATPase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0042803  protein homodimerization activity