ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, slow twitch 2

同義遺伝子名

Endoplasmic reticulum class 1/2 Ca(2+) ATPase, DAR, ATP2B, DD, SR Ca(2+)-ATPase 2, SERCA2, ATP2A2, Calcium pump 2, MGC45367

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:219.30

小脳:214.10

脳幹:-

脳梁:204.10

松果体:-

末梢神経:429.40

脊柱:112.30

網膜:474.60

目:311.50

動脈:60

静脈:-

リンパ節:151.70

末梢血:18.20

脾臓:37.80

胸腺:90.20

骨髄:78.70

脂肪:242

骨:102.40

皮膚:331.20

GeneChip

大脳:10.05

小脳:10.13

脳幹:9.52

脳梁:8.73

松果体:-

末梢神経:8.91

脊柱:8.86

網膜:-

目:-

動脈:8.95

静脈:10.53

リンパ節:7.23

末梢血:-

脾臓:7.48

胸腺:7.35

骨髄:5.95

脂肪:7.98

骨:-

皮膚:8.69

CAGE

大脳:5.25

小脳:-

脳幹:4.83

脳梁:4.86

松果体:4.73

末梢神経:-

脊柱:4.82

網膜:-

目:-

動脈:5.46

静脈:4.72

リンパ節:4.88

末梢血:-

脾臓:4.48

胸腺:3.92

骨髄:-

脂肪:4.53

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

nodata

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:191.40

胎盤:83.80

前立腺:180.20

卵巣:186.30

精巣:225

心臓:562

骨格筋:2672

食道:342.80

胃:212.40

腸:64.80

結腸:118.70

肝臓:147.80

肺:229.70

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:163.70

副腎:152.40

膵臓:142.30

乳腺:269.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.47

胎盤:7.45

前立腺:8.97

卵巣:8.61

精巣:8.01

心臓:11.45

骨格筋:13

食道:10.35

胃:7.98

腸:8.78

結腸:7.94

肝臓:8.12

肺:7.84

膀胱:-

腎臓:7.94

下垂体:7.83

甲状腺:8.24

副腎:8.48

膵臓:6.46

乳腺:8.37

唾液腺:8.20

CAGE

子宮:4.58

胎盤:4.11

前立腺:4.89

卵巣:4.46

精巣:4.79

心臓:7.17

骨格筋:7.00

食道:5.36

胃:-

腸:4.83

結腸:4.89

肝臓:5.01

肺:4.74

膀胱:5.07

腎臓:4.63

下垂体:4.39

甲状腺:5.17

副腎:-

膵臓:4.47

乳腺:4.71

唾液腺:5.37

RNA-seq

nodata

IDs

Refseq ID	NM_001135765
Gene ID	488
Unigene ID	Hs.506759
Probe set ID	212361_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000174437
GTEx ID	ENSG00000174437

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]	NM_001110140, NM_009722
ラット[3]	NM_001110139, NM_001110823

染色体

12q24.11 [110,718,561 - 110,788,898]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006069	ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit
IPR005782	ATPase, P-type, calcium-transporting
IPR000695	ATPase, P-type, H+ transporting proton pump
IPR001757	ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007596	blood coagulation
GO:0007155	cell adhesion
GO:0006874	cellular calcium ion homeostasis
GO:0008544	epidermis development
GO:0006984	ER-nuclear signaling pathway
GO:0034220	ion transmembrane transport
GO:0045822	negative regulation of heart contraction
GO:0010460	positive regulation of heart rate
GO:0002026	regulation of the force of heart contraction
GO:0055119	relaxation of cardiac muscle
GO:0070296	sarcoplasmic reticulum calcium ion transport
GO:0055085	transmembrane transport
GO:0006810	transport

Cellular Component

GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0016020	membrane
GO:0031095	platelet dense tubular network membrane
GO:0016529	sarcoplasmic reticulum
GO:0033017	sarcoplasmic reticulum membrane

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0005388	calcium-transporting ATPase activity
GO:0019899	enzyme binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding