collagen, type V, alpha 3

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同義遺伝子名

collagen, type V, alpha 3, Collagen alpha-3(V) chain precursor, COL5A3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.62 小脳:5.80 脳幹:6.13 脳梁:6.93 松果体:- 末梢神経:7.12 脊柱:6.92 網膜:- 目:- 動脈:6.58 静脈:6.43 リンパ節:6.08 末梢血:- 脾臓:5.39 胸腺:5.56 骨髄:5.80 脂肪:7.59 骨:- 皮膚:6.68
CAGE 大脳:1.51 小脳:- 脳幹:1.81 脳梁:1.41 松果体:1.73 末梢神経:- 脊柱:1.63 網膜:- 目:- 動脈:1.88 静脈:2.84 リンパ節:1.93 末梢血:- 脾臓:0.56 胸腺:0.74 骨髄:- 脂肪:3.93 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.43 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.70 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.45 胎盤:6.82 前立腺:5.66 卵巣:5.59 精巣:5.54 心臓:6.46 骨格筋:6.12 食道:6.22 胃:6.02 腸:6.32 結腸:6.36 肝臓:5.78 肺:6.62 膀胱:- 腎臓:5.57 下垂体:5.49 甲状腺:6.24 副腎:5.93 膵臓:6.22 乳腺:6.86 唾液腺:5.62
CAGE 子宮:3.15 胎盤:3.06 前立腺:2.08 卵巣:1.44 精巣:1.48 心臓:2.45 骨格筋:2.55 食道:2.48 胃:- 腸:1.20 結腸:2.51     肝臓:1.07    肺:2.13 膀胱:2.07 腎臓:0.92 下垂体:0.10 甲状腺:1.28 副腎:- 膵臓:0 乳腺:3.43 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.45 卵巣:0.60 精巣:1.40 心臓:0.90 骨格筋:0.62 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.56     肝臓:0.65        肺:1.39    膀胱:- 腎臓:0.48 下垂体:- 甲状腺:1.10 副腎:1.23 膵臓:- 乳腺:3.84 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015719
Gene ID 50509
Unigene ID -
Probe set ID 52255_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000080573
GTEx ID ENSG00000080573

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_016919
ラット[1]  NM_021760

染色体

19p13.2  [10,070,237  -  10,121,147]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1571108
1916105
6501291
7115902
7346227
8535602
9443080
10722718
11423559
15136578
15316020
19012342

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance
GO:0007160  cell-matrix adhesion
GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0030199  collagen fibril organization
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0043588  skin development

Cellular Component

GO:0005588  collagen type V
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576  extracellular region

Molecular Function

GO:0005518  collagen binding
GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0008201  heparin binding
GO:0043394  proteoglycan binding