poly(A)-specific ribonuclease (deadenylation nuclease)

同義遺伝子名

Poly(A)-specific ribonuclease PARN, Polyadenylate-specific ribonuclease, Deadenylating nuclease, DAN, PARN, Deadenylation nuclease

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:47.40

小脳:63

脳幹:-

脳梁:145.80

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:-

目:47

動脈:239.80

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:72.90

脾臓:37.80

胸腺:141.70

骨髄:118.10

脂肪:-

骨:76.80

皮膚:120

GeneChip

大脳:6.57

小脳:6.06

脳幹:6.74

脳梁:6.53

松果体:-

末梢神経:6.62

脊柱:6.64

網膜:-

目:-

動脈:6.90

静脈:6.86

リンパ節:6.83

末梢血:-

脾臓:6.74

胸腺:6.82

骨髄:6.54

脂肪:6.77

骨:-

皮膚:6.68

CAGE

大脳:3.65

小脳:-

脳幹:3.79

脳梁:3.84

松果体:3.74

末梢神経:-

脊柱:3.87

網膜:-

目:-

動脈:3.76

静脈:3.75

リンパ節:4.00

末梢血:-

脾臓:3.66

胸腺:3.86

骨髄:-

脂肪:3.53

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.38

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.33

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.42

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:40.10

前立腺:33.80

卵巣:37.30

精巣:108.20

心臓:25.50

骨格筋:40.20

食道:-

胃:63.70

腸:64.80

結腸:50.90

肝臓:52.80

肺:53.80

膀胱:125.60

腎臓:62.40

下垂体:-

甲状腺:327.50

副腎:50.80

膵臓:17.80

乳腺:74.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.74

胎盤:6.67

前立腺:6.78

卵巣:6.65

精巣:7.16

心臓:6.52

骨格筋:6.67

食道:6.57

胃:6.68

腸:6.51

結腸:6.55

肝臓:6.60

肺:6.69

膀胱:-

腎臓:6.40

下垂体:7.08

甲状腺:6.84

副腎:6.91

膵臓:6.20

乳腺:6.85

唾液腺:6.60

CAGE

子宮:3.72

胎盤:3.69

前立腺:3.57

卵巣:3.54

精巣:3.88

心臓:3.66

骨格筋:3.32

食道:3.45

胃:-

腸:3.42

結腸:3.63

肝臓:3.46

肺:3.93

膀胱:3.62

腎臓:3.33

下垂体:3.77

甲状腺:3.80

副腎:-

膵臓:3.65

乳腺:3.58

唾液腺:3.48

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.03

卵巣:1.70

精巣:2.70

心臓:1.96

骨格筋:1.76

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.34

肝臓:0.62

肺:1.94

膀胱:-

腎臓:1.18

下垂体:-

甲状腺:2.70

副腎:0.31

膵臓:-

乳腺:1.05

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002582
Gene ID	5073
Unigene ID	Hs.253197
Probe set ID	203905_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000140694
GTEx ID	ENSG00000140694

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_028761
ラット[2]	NM_028761

染色体

16p13.12 [14,529,559 - 14,724,124]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0007292	female gamete generation
GO:0010467	gene expression
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0000288	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0000184	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0000289	nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0009451	RNA modification

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

GO:0046872	metal ion binding
GO:0003730	mRNA 3'-UTR binding
GO:0004518	nuclease activity
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0004535	poly(A)-specific ribonuclease activity
GO:0005515	protein binding
GO:0019901	protein kinase binding

poly(A)-specific ribonuclease (deadenylation nuclease)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function