pre-B-cell leukemia homeobox 2

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同義遺伝子名

pre-B-cell leukemia transcription factor 2, PBX2, Homeobox protein PBX2, Protein G17, G17, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, PBX2MHC, HOX12

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:5.98 小脳:5.49 脳幹:5.89 脳梁:6.02 松果体:- 末梢神経:6.40 脊柱:5.75 網膜:- 目:- 動脈:6.46 静脈:6.57 リンパ節:6.55 末梢血:- 脾臓:6.51 胸腺:6.39 骨髄:7.26 脂肪:6.34 骨:- 皮膚:5.94
CAGE 大脳:2.89 小脳:- 脳幹:3.01 脳梁:3.21 松果体:3.18 末梢神経:- 脊柱:2.83 網膜:- 目:- 動脈:3.31 静脈:3.35 リンパ節:3.48 末梢血:- 脾臓:3.39 胸腺:3.08 骨髄:- 脂肪:2.87 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.35 胎盤:7.93 前立腺:5.84 卵巣:6.33 精巣:6.18 心臓:6.67 骨格筋:6.38 食道:6.35 胃:6.53 腸:6.42 結腸:6.55 肝臓:6.53 肺:6.41 膀胱:- 腎臓:6.45 下垂体:6.79 甲状腺:6.50 副腎:7 膵臓:6.23 乳腺:6.15 唾液腺:6.39
CAGE 子宮:3.37 胎盤:3.52 前立腺:3.37 卵巣:3.16 精巣:2.80 心臓:2.98 骨格筋:2.37 食道:3.40 胃:- 腸:3.05 結腸:3.37     肝臓:2.85    肺:3.53 膀胱:3.22 腎臓:2.98 下垂体:3.08 甲状腺:3.25 副腎:- 膵臓:2.54 乳腺:2.99 唾液腺:3.17
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_002586
Gene ID 5089
Unigene ID -
Probe set ID 202875_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000204304
GTEx ID ENSG00000204304

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_017463
ラット [0]  

染色体

HSCHR6_MHC_APD  [32,163,854  -  32,169,304]
HSCHR6_MHC_COX  [32,100,987  -  32,106,437]
HSCHR6_MHC_QBL  [32,110,133  -  32,115,584]
HSCHR6_MHC_MCF  [32,228,948  -  32,234,390]
6p21.32  [32,152,510  -  32,157,963]
HSCHR6_MHC_MANN  [32,191,945  -  32,197,387]
HSCHR6_MHC_SSTO  [32,159,380  -  32,164,831]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1682799
7759099
7835890
7910944
8661110
9482739
10082572
11438208
12054735
12477932
12609849
12871956
14574404
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14667819
15489334
16344560
17207965
18973687
19322201
19356220
19659809
19851445
19913121
20126986
20416077
20587610
20628086
21804548
22374608
23042114
23266558
23400877
23535732
23667531

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030326  embryonic limb morphogenesis
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009954  proximal/distal pattern formation
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008134  transcription factor binding