exosome component 3

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Ribosomal RNA-processing protein 40, EXOSC3, RP11-3J10.8, RRP40, MGC723, hRrp40p, Exosome component 3, exosome component 3, Exosome complex exonuclease RRP40, MGC15120, p10, Rrp40p, bA3J10.7, CGI-102

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.14 小脳:- 脳幹:3.18 脳梁:3.15 松果体:3.02 末梢神経:- 脊柱:2.68 網膜:- 目:- 動脈:2.73 静脈:3.10 リンパ節:2.98 末梢血:- 脾臓:2.99 胸腺:3.33 骨髄:- 脂肪:2.92 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.56 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.27 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.96 胎盤:2.80 前立腺:3.12 卵巣:3.18 精巣:3.10 心臓:2.80 骨格筋:2.51 食道:2.80 胃:- 腸:2.83 結腸:2.98     肝臓:2.86    肺:2.87 膀胱:2.88 腎臓:2.91 下垂体:3.30 甲状腺:3.07 副腎:- 膵臓:2.81 乳腺:2.64 唾液腺:2.63
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.07 卵巣:0.55 精巣:2.45 心臓:1.22 骨格筋:0.79 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.02     肝臓:1.56        肺:0.31    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:2.32 副腎:1.01 膵臓:- 乳腺:0.50 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001002269
Gene ID 51010
Unigene ID Hs.602571
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000107371
GTEx ID ENSG00000107371

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_025513
ラット [0]  

染色体

9p13.2  [37,766,975  -  37,801,434]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10465791
10810093
11110791
11719186
11782436
11790298
11812149
11879549
12419256
12477932
12788944
15175153
15231747
15342556
15489334
16344560
17174896
17545563
18187620
19056938
20531386
20531389
21139048
21255825
21832049
21890473
21906983
21907836
21963094
22939629
23000965
23564332
23975261

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0071034  CUT catabolic process
GO:0045006  DNA deamination
GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0045190  isotype switching
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0045830  positive regulation of isotype switching
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0006364  rRNA processing

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000177  cytoplasmic exosome (RNase complex)
GO:0005829  cytosol
GO:0000178  exosome (RNase complex)
GO:0000176  nuclear exosome (RNase complex)
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000175  3'-5'-exoribonuclease activity
GO:0004532  exoribonuclease activity
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding