exosome component 1

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同義遺伝子名

EXOSC1, CGI-108, SKI4, Exosome component 1, Csl4p, Ski4p, exosome component 1, CSL4, p13, hCsl4p, 3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:17.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:593.40 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:41.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:18.20 脾臓:56.70 胸腺:77.30 骨髄:78.70 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:91.20
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.21 小脳:- 脳幹:3.30 脳梁:3.23 松果体:3.12 末梢神経:- 脊柱:3.24 網膜:- 目:- 動脈:2.89 静脈:3.29 リンパ節:3.45 末梢血:- 脾臓:3.37 胸腺:3.57 骨髄:- 脂肪:3.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.19 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.89 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.70 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:72.90 胎盤:36.40 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:26 心臓:102.20 骨格筋:20.10 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:67.80     肝臓:21.10        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.17 胎盤:3.20 前立腺:3.18 卵巣:3.22 精巣:3.14 心臓:3.00 骨格筋:3.11 食道:3.27 胃:- 腸:3.16 結腸:3.16     肝臓:3.17    肺:3.07 膀胱:3.23 腎臓:3.09 下垂体:3.55 甲状腺:3.25 副腎:- 膵臓:3.54 乳腺:2.83 唾液腺:3.52
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.00 卵巣:4.05 精巣:4.08 心臓:2.34 骨格筋:3.89 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.45     肝臓:3.79        肺:3.32    膀胱:- 腎臓:3.36 下垂体:- 甲状腺:3.78 副腎:4.26 膵臓:- 乳腺:3.61 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016046
Gene ID 51013
Unigene ID Hs.632089
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000171311
GTEx ID ENSG00000171311

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001164561, NM_025644
ラット[4]  NM_001164561, NM_025644

染色体

10q24.1  [99,190,928  -  99,205,774]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10810093
11110791
11719186
11812149
11879549
12419256
12477932
12788944
14702039
15164054
15231747
15489334
15635413
16344560
17174896
18029348
19060904
20531386
20531389
21139048
21163940
21255825
21832049
21890473
22068837
22174317
22505724
23000965
23349634
23602568
23824909
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0006364  rRNA processing

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0000178  exosome (RNase complex)
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0004532  exoribonuclease activity
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding