tripartite motif-containing 17

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同義遺伝子名

Tripartite motif-containing protein 17, RNF16, tripartite motif-containing 17, Testis RING finger protein, RBCC, TRIM17, RING finger protein 16, TERF, terf

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:27.30 小脳:125.90 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:18.20 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:5.11 小脳:5.53 脳幹:5.01 脳梁:5.04 松果体:- 末梢神経:4.59 脊柱:4.69 網膜:- 目:- 動脈:4.93 静脈:5.53 リンパ節:4.76 末梢血:- 脾臓:4.79 胸腺:4.47 骨髄:5.27 脂肪:4.89 骨:- 皮膚:4.78
CAGE 大脳:2.28 小脳:- 脳幹:0.60 脳梁:0.85 松果体:0.83 末梢神経:- 脊柱:0.90 網膜:- 目:- 動脈:0.34 静脈:0.34 リンパ節:0.24 末梢血:- 脾臓:0.84 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:0.14 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.61 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.09 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.02 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:37.30 精巣:73.50 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.83 胎盤:5.01 前立腺:4.15 卵巣:4.77 精巣:5.55 心臓:5.19 骨格筋:5.38 食道:4.93 胃:4.98 腸:5.25 結腸:5.12 肝臓:4.96 肺:5.23 膀胱:- 腎臓:5.02 下垂体:4.90 甲状腺:4.84 副腎:4.91 膵臓:5.63 乳腺:4.81 唾液腺:5.29
CAGE 子宮:0.93 胎盤:1.14 前立腺:0.81 卵巣:1.00 精巣:1.87 心臓:0.39 骨格筋:0.25 食道:0.46 胃:- 腸:0.14 結腸:0.08     肝臓:0    肺:0.44 膀胱:0.26 腎臓:0.39 下垂体:0.56 甲状腺:0.88 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:1.16 唾液腺:1.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.23 卵巣:0.73 精巣:0.63 心臓:0.02 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.02     肝臓:0        肺:0.50    膀胱:- 腎臓:0.20 下垂体:- 甲状腺:0.69 副腎:0.06 膵臓:- 乳腺:0.23 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001024940
Gene ID 51127
Unigene ID Hs.121748
Probe set ID 220279_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000162931
GTEx ID ENSG00000162931

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_031172
ラット[1]  NM_022798

染色体

1q42.13  [228,595,641  -  228,604,562]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870  B302 (SPRY)-like
IPR003879  Butyrophylin-like
IPR003877  SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355  SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR000315  Zinc finger, B-box

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9792805
10894938
11331580
12477932
14702039
15489334
16189514
16344560
19358823
19472918
19549727
21143188
22023800
22493164
22939624
23105109

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051865  protein autoubiquitination

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005622  intracellular

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding