vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

MGC60323, VPS28, vacuolar protein sorting 28 (yeast)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:54.50

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:-

松果体:296.70

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:-

目:70.50

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:91

末梢血:255.10

脾臓:170.20

胸腺:154.60

骨髄:137.80

脂肪:121

骨:25.60

皮膚:100.80

GeneChip

大脳:7.68

小脳:7.74

脳幹:7.87

脳梁:7.65

松果体:-

末梢神経:8.10

脊柱:7.66

網膜:-

目:-

動脈:8.28

静脈:7.95

リンパ節:8.11

末梢血:-

脾臓:8.19

胸腺:8.14

骨髄:8.08

脂肪:8.10

骨:-

皮膚:8.28

CAGE

大脳:3.86

小脳:-

脳幹:3.79

脳梁:3.96

松果体:3.53

末梢神経:-

脊柱:3.48

網膜:-

目:-

動脈:3.83

静脈:4.05

リンパ節:3.88

末梢血:-

脾臓:3.77

胸腺:3.87

骨髄:-

脂肪:3.80

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.83

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.20

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:6.32

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:72.90

胎盤:65.60

前立腺:78.90

卵巣:149.10

精巣:77.90

心臓:268.20

骨格筋:160.70

食道:342.80

胃:42.50

腸:97.20

結腸:59.40

肝臓:31.70

肺:68.40

膀胱:125.60

腎臓:83.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:142.30

乳腺:74.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.21

胎盤:7.11

前立腺:8.44

卵巣:8.59

精巣:8.87

心臓:7.78

骨格筋:7.94

食道:8.25

胃:7.89

腸:7.95

結腸:7.94

肝臓:7.66

肺:8.38

膀胱:-

腎臓:8.33

下垂体:8.05

甲状腺:8.63

副腎:7.85

膵臓:7.67

乳腺:8.40

唾液腺:8.37

CAGE

子宮:4.15

胎盤:3.62

前立腺:4.07

卵巣:4.01

精巣:4.55

心臓:4.06

骨格筋:4.09

食道:4.21

胃:-

腸:4.17

結腸:4.03

肝臓:4.22

肺:3.94

膀胱:3.79

腎臓:4.16

下垂体:3.54

甲状腺:4.21

副腎:-

膵臓:4.28

乳腺:3.64

唾液腺:4.45

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.85

卵巣:5.72

精巣:5.97

心臓:4.32

骨格筋:5.48

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.44

肝臓:5.43

肺:5.66

膀胱:-

腎臓:5.99

下垂体:-

甲状腺:5.70

副腎:5.71

膵臓:-

乳腺:5.28

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_016208
Gene ID	51160
Unigene ID	Hs.418175
Probe set ID	218679_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000160948
GTEx ID	ENSG00000160948

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_025842
ラット[1]	NM_001130492

染色体

8q24.3 [145,649,000 - 145,653,931]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0046788	egress of virus within host cell
GO:0016197	endosome transport
GO:0016044	membrane organization
GO:0031397	negative regulation of protein ubiquitination
GO:0015031	protein transport
GO:0043162	ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway
GO:0019067	viral assembly, maturation, egress, and release
GO:0019082	viral protein processing
GO:0016032	viral reproduction
GO:0019068	virion assembly

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005768	endosome
GO:0010008	endosome membrane
GO:0000813	ESCRT I complex
GO:0031902	late endosome membrane
GO:0005886	plasma membrane

vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function