PHD finger protein 20

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同義遺伝子名

chromosome 20 open reading frame 104, Hepatocellular carcinoma-associated antigen 58, FLJ33479, PHD finger protein 20, NZF, Novel zinc finger protein, TZP, C20orf104, PHF20, GLEA2, HCA58, Glioma-expressed antigen 2, dJ1121G12.1, Transcription factor TZP

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:69.90 小脳:151.10 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:76.40 動脈:119.90 静脈:- リンパ節:101.10 末梢血:18.20 脾臓:56.70 胸腺:51.50 骨髄:78.70 脂肪:80.70 骨:51.20 皮膚:76.80
GeneChip 大脳:7.88 小脳:8.13 脳幹:7.64 脳梁:7.87 松果体:- 末梢神経:7.99 脊柱:7.70 網膜:- 目:- 動脈:7.78 静脈:8.01 リンパ節:8.10 末梢血:- 脾臓:8.46 胸腺:7.93 骨髄:7.37 脂肪:7.61 骨:- 皮膚:7.38
CAGE 大脳:3.92 小脳:- 脳幹:3.88 脳梁:3.93 松果体:4.10 末梢神経:- 脊柱:4.13 網膜:- 目:- 動脈:3.87 静脈:4.17 リンパ節:4.02 末梢血:- 脾臓:4.14 胸腺:3.91 骨髄:- 脂肪:4.11 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.29 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.31 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.08 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:43.70 前立腺:33.80 卵巣:111.80 精巣:82.20 心臓:12.80 骨格筋:100.50 食道:- 胃:63.70 腸:- 結腸:93.30     肝臓:126.70        肺:73.30    膀胱:- 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:120.80 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.92 胎盤:6.90 前立腺:7.72 卵巣:7.94 精巣:8.32 心臓:7.74 骨格筋:7.89 食道:7.59 胃:7.86 腸:7.37 結腸:7.54 肝臓:7.18 肺:7.99 膀胱:- 腎臓:7.29 下垂体:7.26 甲状腺:7.66 副腎:7.77 膵臓:6.77 乳腺:8.05 唾液腺:7.27
CAGE 子宮:4.03 胎盤:3.46 前立腺:3.85 卵巣:3.86 精巣:3.58 心臓:3.68 骨格筋:4.39 食道:3.66 胃:- 腸:3.45 結腸:3.50     肝臓:2.85    肺:4.13 膀胱:4.06 腎臓:3.46 下垂体:4.02 甲状腺:3.56 副腎:- 膵臓:3.29 乳腺:3.67 唾液腺:3.97
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.62 卵巣:3.39 精巣:3.59 心臓:2.41 骨格筋:4.17 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.38     肝臓:1.43        肺:3.86    膀胱:- 腎臓:2.74 下垂体:- 甲状腺:3.45 副腎:2.99 膵臓:- 乳腺:2.83 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016436
Gene ID 51230
Unigene ID Hs.517044
Probe set ID 206567_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000025293
GTEx ID ENSG00000025293

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_172674
ラット[1]  NM_001107795

染色体

20q11.22  [34,359,896  -  34,538,303]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002999  Tudor domain
IPR015880  Zinc finger, C2H2-like
IPR007087  Zinc finger, C2H2-type
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889549
11703362
11780052
12097419
12477932
12800201
14702039
15489334
15906353
15960975
16415788
16751776
17081983
18029348
18478111
19473719
20360068
20467438
20479123
21963094
22334668
22449972
22864287
22939629
22975685
23793025
23797602
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043984  histone H4-K16 acetylation
GO:0043981  histone H4-K5 acetylation
GO:0043982  histone H4-K8 acetylation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000123  histone acetyltransferase complex
GO:0071339  MLL1 complex
GO:0031965  nuclear membrane
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0046972  histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific)
GO:0043995  histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific)
GO:0043996  histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific)
GO:0008270  zinc ion binding