SCAN domain containing 1

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同義遺伝子名

SCAN domain-containing 1, SDP1, SCAND1, SCAN domain-containing protein 1, SCAN domain containing 1, RAZ1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:22.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:52.90

動脈:30

静脈:-

リンパ節:141.50

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:38.40

GeneChip

大脳:6.75

小脳:6.15

脳幹:6.98

脳梁:6.30

松果体:-

末梢神経:6.73

脊柱:6.44

網膜:-

目:-

動脈:7.14

静脈:6.61

リンパ節:6.90

末梢血:-

脾臓:6.73

胸腺:7.30

骨髄:6.78

脂肪:6.88

骨:-

皮膚:7.24

CAGE

大脳:3.74

小脳:-

脳幹:3.53

脳梁:3.44

松果体:3.42

末梢神経:-

脊柱:3.55

網膜:-

目:-

動脈:4.00

静脈:4.00

リンパ節:3.88

末梢血:-

脾臓:3.89

胸腺:4.23

骨髄:-

脂肪:3.70

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.17

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.89

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.91

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:45.60

胎盤:47.40

前立腺:45.10

卵巣:37.30

精巣:17.30

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:42.40

肝臓:-

肺:44

膀胱:-

腎臓:197.50

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:71.10

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.88

胎盤:6.28

前立腺:7.69

卵巣:6.91

精巣:7.39

心臓:6.41

骨格筋:6.60

食道:6.90

胃:6.47

腸:6.85

結腸:6.82

肝臓:7.06

肺:6.69

膀胱:-

腎臓:7.42

下垂体:7.14

甲状腺:7.22

副腎:7.05

膵臓:7.23

乳腺:7.14

唾液腺:6.88

CAGE

子宮:3.80

胎盤:3.66

前立腺:3.85

卵巣:3.89

精巣:4.31

心臓:3.88

骨格筋:4.54

食道:3.94

胃:-

腸:4.09

結腸:4.24

肝臓:4.38

肺:3.87

膀胱:3.60

腎臓:4.09

下垂体:3.49

甲状腺:4.08

副腎:-

膵臓:4.07

乳腺:4.03

唾液腺:4.16

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.26

卵巣:1.06

精巣:1.44

心臓:1.10

骨格筋:1.02

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.38

肝臓:1.51

肺:1.32

膀胱:-

腎臓:1.37

下垂体:-

甲状腺:2.94

副腎:2.09

膵臓:-

乳腺:1.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_016558
Gene ID	51282
Unigene ID	Hs.584909
Probe set ID	218206_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000171222
GTEx ID	ENSG00000171222

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_020255
ラット [0]

染色体

20q11.23 [34,541,539 - 34,547,394]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed (Pubmed ID)

10567577
10747874
10777584
11076863
11256614
11780052
12383503
12444922
12477932
15489334
15489336
16189514
16381901
16540086
18660489
20211142
21139048
21900206
24250222

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

Molecular Function

GO:0042802	identical protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0003700	transcription factor activity