protocadherin 12

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同義遺伝子名

Vascular cadherin-2, Protocadherin-12 precursor, protocadherin 12, VE-cad-2, PCDH12, VE-cadherin-2, UNQ395/PRO731, VECAD2, Vascular endothelial cadherin-2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:20.10 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:119.90 静脈:866.40 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:151.30 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:51.20 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:6.03 小脳:5.77 脳幹:6.06 脳梁:5.74 松果体:- 末梢神経:6.12 脊柱:5.72 網膜:- 目:- 動脈:6.58 静脈:6.30 リンパ節:6.20 末梢血:- 脾臓:7.16 胸腺:5.54 骨髄:6 脂肪:6.55 骨:- 皮膚:6.23
CAGE 大脳:0.73 小脳:- 脳幹:0.95 脳梁:0.99 松果体:0.86 末梢神経:- 脊柱:0.32 網膜:- 目:- 動脈:1.91 静脈:1.83 リンパ節:1.14 末梢血:- 脾臓:3.40 胸腺:0.68 骨髄:- 脂肪:3.36 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.16 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.17 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.06 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:98.40 前立腺:- 卵巣:- 精巣:13 心臓:25.50 骨格筋:60.30 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:10.60        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.26 胎盤:6.87 前立腺:5.96 卵巣:6.07 精巣:5.83 心臓:6.52 骨格筋:6.20 食道:5.93 胃:6.07 腸:6.18 結腸:6.18 肝臓:6.46 肺:6.86 膀胱:- 腎臓:6.35 下垂体:6.27 甲状腺:6.41 副腎:6.79 膵臓:6.19 乳腺:6.14 唾液腺:5.94
CAGE 子宮:1.97 胎盤:3.69 前立腺:1.88 卵巣:1.85 精巣:0.86 心臓:2.52 骨格筋:1.20 食道:1.62 胃:- 腸:1.37 結腸:0.77     肝臓:2.05    肺:3.04 膀胱:1.80 腎臓:2.05 下垂体:1.25 甲状腺:2.34 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:2.83 唾液腺:1.39
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.67 卵巣:1.27 精巣:0.66 心臓:1.93 骨格筋:0.32 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.30     肝臓:1.05        肺:3.84    膀胱:- 腎臓:1.46 下垂体:- 甲状腺:1.99 副腎:1.97 膵臓:- 乳腺:2.32 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016580
Gene ID 51294
Unigene ID Hs.439474
Probe set ID 219656_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000113555
GTEx ID ENSG00000113555

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_017378
ラット [0]  

染色体

5q31.3  [141,323,150  -  141,349,304]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9651350
10380929
10716726
10817752
10835267
11063261
12477932
12975309
14702039
19054571
21402705

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016339  calcium-dependent cell-cell adhesion
GO:0005977  glycogen metabolic process
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0060711  labyrinthine layer development
GO:0008038  neuron recognition

Cellular Component

GO:0005911  cell-cell junction
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding