cell division cycle 40 homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

hPRP17, Ehb3, cell division cycle 40 homolog (S. cerevisiae), FLJ10564, Cell division cycle 40 homolog, Pre-mRNA-splicing factor PRP17, PRPF17, MGC102802, CDC40, EH-binding protein 3, EHB3, cell division cycle 40 homolog (yeast), PRP17

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:37.90 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:64.60 動脈:89.90 静脈:- リンパ節:50.60 末梢血:18.20 脾臓:37.80 胸腺:38.70 骨髄:39.40 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:28.80
GeneChip 大脳:4.13 小脳:3.87 脳幹:3.87 脳梁:3.90 松果体:- 末梢神経:3.83 脊柱:3.64 網膜:- 目:- 動脈:3.72 静脈:3.97 リンパ節:4.10 末梢血:- 脾臓:4.36 胸腺:4.87 骨髄:4.25 脂肪:3.81 骨:- 皮膚:3.81
CAGE 大脳:3.74 小脳:- 脳幹:3.53 脳梁:3.44 松果体:3.78 末梢神経:- 脊柱:3.32 網膜:- 目:- 動脈:3.11 静脈:3.60 リンパ節:3.68 末梢血:- 脾臓:3.93 胸腺:4.06 骨髄:- 脂肪:3.51 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.39 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.82 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.61 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:25.50 前立腺:22.50 卵巣:37.30 精巣:21.60 心臓:12.80 骨格筋:20.10 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:76.30     肝臓:52.80        肺:63.50    膀胱:125.60 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:106.70 乳腺:232.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.04 胎盤:3.98 前立腺:4.08 卵巣:4.18 精巣:4.63 心臓:3.89 骨格筋:3.90 食道:3.81 胃:3.85 腸:4.04 結腸:3.85 肝臓:4.01 肺:3.88 膀胱:- 腎臓:3.88 下垂体:3.74 甲状腺:3.80 副腎:3.94 膵臓:3.72 乳腺:3.92 唾液腺:3.60
CAGE 子宮:3.63 胎盤:3.28 前立腺:3.45 卵巣:3.51 精巣:3.01 心臓:3.25 骨格筋:2.99 食道:3.47 胃:- 腸:3.55 結腸:3.13     肝臓:3.69    肺:3.39 膀胱:3.54 腎臓:3.83 下垂体:4.18 甲状腺:3.56 副腎:- 膵臓:2.71 乳腺:2.99 唾液腺:3.32
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.25 卵巣:3.17 精巣:3.12 心臓:2.26 骨格筋:2.21 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.67     肝臓:2.27        肺:1.86    膀胱:- 腎臓:3.11 下垂体:- 甲状腺:3.35 副腎:3.12 膵臓:- 乳腺:2.83 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015891
Gene ID 51362
Unigene ID Hs.428147
Probe set ID 203377_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000168438
GTEx ID ENSG00000168438

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_027879
ラット[1]  NM_001108538

染色体

6q21  [110,501,344  -  110,575,478]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7568168
8125298
8889548
9303539
9524131
9769104
9830021
11102353
11991638
12226669
12477932
14574404
14702039
15489334
15761153
17081983
18976975
19420964
20360068
20508642
20614026
22365833
23084401
24457600
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0031124  mRNA 3'-end processing
GO:0006406  mRNA export from nucleus
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380  RNA splicing
GO:0006369  termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005681  spliceosomal complex