phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

p17 protein, PDED, PDE6D, GMP-PDE delta, phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:14.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:118.60 目:70.50 動脈:30 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:59 脂肪:- 骨:- 皮膚:19.20
GeneChip 大脳:7.18 小脳:7 脳幹:7.32 脳梁:7.25 松果体:- 末梢神経:7.30 脊柱:7.65 網膜:- 目:- 動脈:6.57 静脈:6.33 リンパ節:6.73 末梢血:- 脾臓:6.91 胸腺:7.62 骨髄:6.41 脂肪:6.57 骨:- 皮膚:6.30
CAGE 大脳:2.51 小脳:- 脳幹:2.68 脳梁:2.78 松果体:3.13 末梢神経:- 脊柱:2.29 網膜:- 目:- 動脈:2.08 静脈:1.65 リンパ節:2.10 末梢血:- 脾臓:2.12 胸腺:2.59 骨髄:- 脂肪:1.51 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.98 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.69 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.31 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:29.10 前立腺:- 卵巣:- 精巣:43.30 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:32.40 結腸:17     肝臓:-        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.66 胎盤:6.81 前立腺:6.69 卵巣:6.41 精巣:7.59 心臓:6.34 骨格筋:6.13 食道:6.70 胃:6.62 腸:6.55 結腸:6.64 肝臓:6.20 肺:6.44 膀胱:- 腎臓:6.53 下垂体:7.10 甲状腺:6.62 副腎:6.98 膵臓:5.54 乳腺:6.52 唾液腺:6.66
CAGE 子宮:2.09 胎盤:1.98 前立腺:2.10 卵巣:1.94 精巣:3.15 心臓:1.69 骨格筋:1.52 食道:2.08 胃:- 腸:1.94 結腸:2.02     肝臓:1.60    肺:2.03 膀胱:1.99 腎臓:2.02 下垂体:2.07 甲状腺:2.06 副腎:- 膵臓:2.18 乳腺:1.53 唾液腺:2.31
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.03 卵巣:3.37 精巣:4.48 心臓:2.81 骨格筋:2.52 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.45     肝臓:2.22        肺:3.35    膀胱:- 腎臓:3.66 下垂体:- 甲状腺:2.73 副腎:3.62 膵臓:- 乳腺:2.97 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_002601
Gene ID 5147
Unigene ID Hs.516808
Probe set ID 204091_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000156973
GTEx ID ENSG00000156973

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_008801
ラット[1]  NM_001108806

染色体

2q37.1  [232,597,135  -  232,650,982]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008015  GMP phosphodiesterase, delta subunit
IPR017287  Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3', 5'-cyclic phosphodiesterase, delta subunit

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8798640
9533031
9570951
9712853
9781033
9990021
10373499
10518933
11786539
11980706
12477932
15489334
16169070
16189514
16473576
16527812
18391951
21139048
21145461
22179043
23150559
23301619
23559067
23568457
24166846
24401286
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0033124  regulation of GTP catabolic process
GO:0050896  response to stimulus
GO:0007601  visual perception

Molecular Function

GO:0004114  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity
GO:0005095  GTPase inhibitor activity
GO:0005515  protein binding