histone deacetylase 7

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同義遺伝子名

histone deacetylase 7A, HDAC7A, DKFZP586J0917, Histone deacetylase 7a, HDAC7, HD7a

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:59.30

小脳:63

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:153.40

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:94

動脈:-

静脈:266.60

リンパ節:182

末梢血:36.40

脾臓:56.70

胸腺:747.30

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:64

皮膚:62.40

GeneChip

大脳:6.95

小脳:7.38

脳幹:6.76

脳梁:7.21

松果体:-

末梢神経:6.80

脊柱:6.67

網膜:-

目:-

動脈:7.32

静脈:7.64

リンパ節:7.65

末梢血:-

脾臓:7.64

胸腺:8.39

骨髄:7.27

脂肪:7.59

骨:-

皮膚:6.90

CAGE

大脳:2.97

小脳:-

脳幹:3.11

脳梁:3.38

松果体:3.22

末梢神経:-

脊柱:3.46

網膜:-

目:-

動脈:4.07

静脈:4.54

リンパ節:3.90

末梢血:-

脾臓:4.14

胸腺:5.38

骨髄:-

脂肪:4.34

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.43

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.08

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.46

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:43.70

前立腺:11.30

卵巣:111.80

精巣:47.60

心臓:51.10

骨格筋:20.10

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:59.40

肝臓:42.20

肺:68.40

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:26.70

乳腺:74.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.40

胎盤:6.76

前立腺:6.36

卵巣:7.61

精巣:6.40

心臓:7.63

骨格筋:6.97

食道:7.26

胃:7.40

腸:7.13

結腸:7.49

肝臓:7

肺:7.60

膀胱:-

腎臓:7.42

下垂体:7.09

甲状腺:7.29

副腎:7.87

膵臓:7.16

乳腺:7.46

唾液腺:7.33

CAGE

子宮:4.55

胎盤:3.92

前立腺:4.17

卵巣:4.35

精巣:3.49

心臓:4.09

骨格筋:3.29

食道:4.07

胃:-

腸:2.94

結腸:3.65

肝臓:2.68

肺:4.33

膀胱:4.33

腎臓:3.57

下垂体:3.33

甲状腺:3.80

副腎:-

膵臓:2.98

乳腺:4.41

唾液腺:3.77

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.70

卵巣:2.18

精巣:1.53

心臓:1.06

骨格筋:0.34

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.19

肝臓:0.16

肺:2.98

膀胱:-

腎臓:1.89

下垂体:-

甲状腺:2.20

副腎:1.96

膵臓:-

乳腺:2.10

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_015401
Gene ID	51564
Unigene ID	Hs.200063
Probe set ID	217937_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000061273
GTEx ID	ENSG00000061273

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001204275, NM_001204276, NM_001204277, NM_001204278, NM_001204279, NM_001204280, NM_001204281, NM_019572
ラット[2]	NM_001204275, NM_001204276, NM_001204277, NM_001204278, NM_001204279, NM_001204280, NM_001204281, NM_019572

染色体

12q13.11 [48,176,505 - 48,226,915]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017320	Histone deacetylase class II, eukaryotic
IPR000286	Histone deacetylase superfamily

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007043	cell-cell junction assembly
GO:0032703	negative regulation of interleukin-2 production
GO:0045668	negative regulation of osteoblast differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0007219	Notch signaling pathway
GO:0090050	positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0001570	vasculogenesis

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000118	histone deacetylase complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0032041	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970	NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515	protein binding
GO:0019901	protein kinase binding
GO:0005080	protein kinase C binding
GO:0033613	transcription activator binding
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0070491	transcription repressor binding

histone deacetylase 7

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function