phosphodiesterase 6B, cGMP-specific, rod, beta

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同義遺伝子名

rd1, PDE6B, GMP-PDE beta, PDEB, CSNB3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:4.87

小脳:4.71

脳幹:5.01

脳梁:5.58

松果体:-

末梢神経:4.59

脊柱:5.21

網膜:-

目:-

動脈:4.64

静脈:4.47

リンパ節:4.61

末梢血:-

脾臓:4.65

胸腺:4.66

骨髄:4.91

脂肪:4.59

骨:-

皮膚:4.81

CAGE

大脳:2.80

小脳:-

脳幹:3.50

脳梁:4.01

松果体:3.51

末梢神経:-

脊柱:3.19

網膜:-

目:-

動脈:1.61

静脈:2.31

リンパ節:2.32

末梢血:-

脾臓:1.91

胸腺:2.42

骨髄:-

脂肪:0.96

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.47

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.37

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.25

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.59

胎盤:4.60

前立腺:4.51

卵巣:4.68

精巣:4.53

心臓:4.46

骨格筋:4.61

食道:4.47

胃:4.45

腸:4.66

結腸:4.71

肝臓:4.68

肺:4.70

膀胱:-

腎臓:4.63

下垂体:4.82

甲状腺:5.01

副腎:4.50

膵臓:4.55

乳腺:4.67

唾液腺:4.58

CAGE

子宮:1.24

胎盤:1.05

前立腺:1.61

卵巣:1.48

精巣:1.45

心臓:1.26

骨格筋:0.13

食道:1.14

胃:-

腸:0.96

結腸:1.02

肝臓:0.26

肺:1.84

膀胱:0.83

腎臓:1.21

下垂体:2.64

甲状腺:2.12

副腎:-

膵臓:1.59

乳腺:0.55

唾液腺:1.28

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.64

卵巣:0.75

精巣:0.78

心臓:0.24

骨格筋:0.06

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.15

肝臓:0.12

肺:0.75

膀胱:-

腎臓:0.94

下垂体:-

甲状腺:1.88

副腎:1.64

膵臓:-

乳腺:0.51

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001145292
Gene ID	5158
Unigene ID	Hs.623810
Probe set ID	210304_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000133256
GTEx ID	ENSG00000133256

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008806
ラット[1]	NM_001106024

染色体

4p16.3 [619,373 - 664,571]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003018	GAF
IPR003607	Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain

GO:0007596	blood coagulation
GO:0051480	cytosolic calcium ion homeostasis
GO:0046037	GMP metabolic process
GO:0007603	phototransduction, visible light
GO:0022400	regulation of rhodopsin mediated signaling pathway
GO:0060041	retina development in camera-type eye
GO:0016056	rhodopsin mediated signaling pathway
GO:0007601	visual perception

GO:0047555	3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity
GO:0046872	metal ion binding

phosphodiesterase 6B, cGMP-specific, rod, beta

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Molecular Function