PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog (S. cerevisiae)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

cleavage and polyadenylation factor II subunit, KIAA0824, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, Pre-mRNA cleavage complex II protein Pcf11, PCF11

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:43.90 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:47 動脈:- 静脈:- リンパ節:101.10 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:77.30 骨髄:- 脂肪:201.70 骨:25.60 皮膚:62.40
GeneChip 大脳:5.93 小脳:6.72 脳幹:5.92 脳梁:6.48 松果体:- 末梢神経:6.16 脊柱:5.88 網膜:- 目:- 動脈:5.57 静脈:5.06 リンパ節:6.50 末梢血:- 脾臓:7.02 胸腺:7.28 骨髄:5.66 脂肪:5.96 骨:- 皮膚:6.56
CAGE 大脳:3.50 小脳:- 脳幹:3.51 脳梁:3.29 松果体:3.87 末梢神経:- 脊柱:3.63 網膜:- 目:- 動脈:3.35 静脈:3.96 リンパ節:3.47 末梢血:- 脾臓:3.49 胸腺:3.83 骨髄:- 脂肪:3.49 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.28 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.71 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.27 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:36.40 前立腺:45.10 卵巣:37.30 精巣:86.50 心臓:25.50 骨格筋:40.20 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:93.30     肝臓:63.30        肺:48.90    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:195.60 乳腺:65.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.81 胎盤:6.53 前立腺:6.64 卵巣:6.85 精巣:5.74 心臓:5.68 骨格筋:6.30 食道:5.54 胃:5.94 腸:5.58 結腸:5.50 肝臓:6.16 肺:6.57 膀胱:- 腎臓:5.69 下垂体:5.90 甲状腺:6.17 副腎:5.81 膵臓:5.14 乳腺:6.49 唾液腺:5.79
CAGE 子宮:3.50 胎盤:3.52 前立腺:3.65 卵巣:3.41 精巣:3.50 心臓:3.19 骨格筋:3.81 食道:3.40 胃:- 腸:3.32 結腸:3.29     肝臓:2.63    肺:3.65 膀胱:3.61 腎臓:3.29 下垂体:4.15 甲状腺:3.36 副腎:- 膵臓:3.10 乳腺:3.38 唾液腺:3.08
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.96 卵巣:3.51 精巣:3.35 心臓:2.16 骨格筋:1.94 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.25     肝臓:2.13        肺:2.16    膀胱:- 腎臓:3.27 下垂体:- 甲状腺:3.43 副腎:3.43 膵臓:- 乳腺:2.91 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015885
Gene ID 51585
Unigene ID Hs.128959
Probe set ID 203378_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000165494
GTEx ID ENSG00000165494

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_029078
ラット[2]  NM_029078

染色体

11q14.1  [82,868,030  -  82,898,493]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006569  RNA polymerase II, large subunit, CTD

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10048485
11060040
12226669
12477932
15302935
15489334
16159877
16344560
17081983
17606639
18086705
19110458
19471022
20360068
21139048
22751105
22939629
23251661
23326517
24332808
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0031124  mRNA 3'-end processing
GO:0006379  mRNA cleavage
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380  RNA splicing
GO:0006369  termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005849  mRNA cleavage factor complex
GO:0005654  nucleoplasm