LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

YJR022W, LSM8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:5.14 小脳:5.11 脳幹:5.41 脳梁:5.30 松果体:- 末梢神経:5.41 脊柱:5.48 網膜:- 目:- 動脈:6.17 静脈:6.41 リンパ節:6.71 末梢血:- 脾臓:6.59 胸腺:7.94 骨髄:6.33 脂肪:6.38 骨:- 皮膚:6.70
CAGE 大脳:3.95 小脳:- 脳幹:3.81 脳梁:3.51 松果体:4.10 末梢神経:- 脊柱:4.44 網膜:- 目:- 動脈:4.22 静脈:4.08 リンパ節:4.17 末梢血:- 脾臓:3.87 胸腺:4.10 骨髄:- 脂肪:3.64 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.88 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.93 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.59 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.62 胎盤:6 前立腺:7.16 卵巣:6.41 精巣:6.87 心臓:6.13 骨格筋:5.88 食道:6.57 胃:6.18 腸:6.21 結腸:6.23 肝臓:5.38 肺:6.06 膀胱:- 腎臓:5.62 下垂体:5.92 甲状腺:6.27 副腎:5.84 膵臓:6.31 乳腺:6.45 唾液腺:6.42
CAGE 子宮:3.92 胎盤:3.47 前立腺:3.67 卵巣:3.63 精巣:3.85 心臓:4.10 骨格筋:3.78 食道:3.66 胃:- 腸:3.80 結腸:3.95     肝臓:3.49    肺:3.97 膀胱:3.87 腎臓:3.81 下垂体:4.31 甲状腺:3.44 副腎:- 膵臓:3.57 乳腺:4.01 唾液腺:3.91
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.73 卵巣:2.19 精巣:1.73 心臓:1.18 骨格筋:0.78 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.31     肝臓:1.04        肺:1.44    膀胱:- 腎臓:1.73 下垂体:- 甲状腺:1.91 副腎:2.01 膵臓:- 乳腺:1.72 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016200
Gene ID 51691
Unigene ID -
Probe set ID 219119_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000128534
GTEx ID ENSG00000128534

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_133939
ラット[1]  NM_001106585

染色体

7q31.31  [117,824,086  -  117,832,878]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9847074
10369684
10523320
11920408
12477932
12690205
12853948
14667819
14702039
15231747
15489334
16051491
16344560
17620012
19398576
19615732
19660095
20360068
21139048
21988832
22365833
22863883
22875987
22939629
23667531
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0017070  U6 snRNA binding