Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6

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同義遺伝子名

RA-GEF-2, DKFZp686I15116, RAPGEF6, PDZGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, PDZ-GEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, KIA001LB

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:36.70 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:118.60 目:17.60 動脈:30 静脈:- リンパ節:212.30 末梢血:54.70 脾臓:37.80 胸腺:64.40 骨髄:157.40 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:24
GeneChip 大脳:6.62 小脳:7.64 脳幹:6.63 脳梁:7.29 松果体:- 末梢神経:6.84 脊柱:6.66 網膜:- 目:- 動脈:6.22 静脈:6.02 リンパ節:7.62 末梢血:- 脾臓:7.42 胸腺:7.61 骨髄:7.08 脂肪:5.90 骨:- 皮膚:5.96
CAGE 大脳:3.67 小脳:- 脳幹:3.96 脳梁:3.87 松果体:3.79 末梢神経:- 脊柱:3.60 網膜:- 目:- 動脈:2.98 静脈:3.45 リンパ節:3.56 末梢血:- 脾臓:3.51 胸腺:4.06 骨髄:- 脂肪:3.09 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.38 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:32.80 前立腺:67.60 卵巣:37.30 精巣:38.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:67.80     肝臓:42.20        肺:39.10    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.19 胎盤:6.06 前立腺:6.41 卵巣:6.27 精巣:5.77 心臓:5.53 骨格筋:5.63 食道:6.05 胃:6.26 腸:5.74 結腸:5.76 肝臓:6.11 肺:6.59 膀胱:- 腎臓:5.57 下垂体:5.92 甲状腺:6.20 副腎:5.97 膵臓:4.97 乳腺:6.73 唾液腺:5.59
CAGE 子宮:3.27 胎盤:2.90 前立腺:3.13 卵巣:3.05 精巣:3.51 心臓:2.97 骨格筋:2.86 食道:2.92 胃:- 腸:2.80 結腸:3.38     肝臓:2.51    肺:3.39 膀胱:3.19 腎臓:2.80 下垂体:3.38 甲状腺:2.90 副腎:- 膵臓:2.90 乳腺:3.19 唾液腺:2.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.77 卵巣:0.00 精巣:1.32 心臓:0.23 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.59     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.68 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001164386
Gene ID 51735
Unigene ID Hs.483329
Probe set ID 219112_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000158987
GTEx ID ENSG00000158987

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_175258
ラット[1]  NM_001107003

染色体

5q31.1  [130,759,614  -  130,970,929]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000595  Cyclic nucleotide-binding
IPR018490  Cyclic nucleotide-binding-like
IPR014710  RmlC-like jelly roll fold

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11524421
12095257
12477932
12581858
14698303
14702039
15302935
15324660
16055720
16192288
16344560
17030554
17081983
18029348
18585005
18718982
18804346
19176753
19460752
20800573
21139048
24250222
24255178

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007265  Ras protein signal transduction
GO:0043087  regulation of GTPase activity
GO:0051056  regulation of small GTPase mediated signal transduction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0030742  GTP-dependent protein binding
GO:0005085  guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0017016  Ras GTPase binding