lysine (K)-specific demethylase 3B

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同義遺伝子名

Nuclear protein 5qNCA, 5qNCA, C5orf7, JMJD1B, jumonji domain containing 1B, KIAA1082, chromosome 5 open reading frame 7, JHDM2B, Jumonji domain-containing protein 1B

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.86 小脳:7.99 脳幹:7.70 脳梁:8.17 松果体:- 末梢神経:7.93 脊柱:8.07 網膜:- 目:- 動脈:7.95 静脈:8.01 リンパ節:8.19 末梢血:- 脾臓:8.31 胸腺:8.38 骨髄:8.25 脂肪:8.11 骨:- 皮膚:7.95
CAGE 大脳:2.71 小脳:- 脳幹:2.80 脳梁:3.12 松果体:3.09 末梢神経:- 脊柱:2.58 網膜:- 目:- 動脈:3.06 静脈:2.56 リンパ節:2.72 末梢血:- 脾臓:2.55 胸腺:3.18 骨髄:- 脂肪:2.72 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.12 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.37 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.80 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:8.31 胎盤:8.01 前立腺:8.34 卵巣:8.66 精巣:8.18 心臓:7.85 骨格筋:7.99 食道:7.93 胃:8.02 腸:7.88 結腸:8.07 肝臓:7.39 肺:8.09 膀胱:- 腎臓:8.02 下垂体:8.01 甲状腺:8.39 副腎:7.91 膵臓:7.30 乳腺:8.47 唾液腺:7.88
CAGE 子宮:2.85 胎盤:2.38 前立腺:2.84 卵巣:3.00 精巣:2.65 心臓:2.57 骨格筋:2.73 食道:2.65 胃:- 腸:2.79 結腸:3.05     肝臓:1.76    肺:2.73 膀胱:2.94 腎臓:2.56 下垂体:2.82 甲状腺:2.85 副腎:- 膵臓:2.98 乳腺:2.74 唾液腺:2.97
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.32 卵巣:4.18 精巣:3.94 心臓:3.25 骨格筋:4.46 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.55     肝臓:2.01        肺:3.40    膀胱:- 腎臓:3.23 下垂体:- 甲状腺:4.24 副腎:3.80 膵臓:- 乳腺:3.56 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016604
Gene ID 51780
Unigene ID -
Probe set ID 201643_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000120733
GTEx ID ENSG00000120733

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001081256
ラット[1]  NM_001081256

染色体

5q31.2  [137,688,285  -  137,772,717]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10470851
10737800
11087669
11161817
11687974
12168954
12477932
15138608
15231748
15302935
15489334
15635413
16603237
17081983
18029348
19322201
19471022
19615732
20379614
20400511
21102462
21139048
21693764
21890473
21906983
21963094
22505724
22615488
22863883
23000965
23266085
23383273
23455924
24550385
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen