PHD finger protein 1

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同義遺伝子名

PHF2, Protein PHF1, PHF1, PHD finger protein 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:37.90

小脳:75.60

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:64.60

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:121.30

末梢血:54.70

脾臓:75.60

胸腺:103.10

骨髄:59

脂肪:-

骨:102.40

皮膚:24

GeneChip

大脳:6.26

小脳:6.26

脳幹:6.23

脳梁:6.35

松果体:-

末梢神経:6.25

脊柱:6.17

網膜:-

目:-

動脈:6.47

静脈:6.46

リンパ節:6.80

末梢血:-

脾臓:6.83

胸腺:5.80

骨髄:6

脂肪:6.36

骨:-

皮膚:5.65

CAGE

大脳:3.46

小脳:-

脳幹:3.51

脳梁:3.25

松果体:3.93

末梢神経:-

脊柱:3.72

網膜:-

目:-

動脈:4.06

静脈:4.01

リンパ節:3.42

末梢血:-

脾臓:3.41

胸腺:2.53

骨髄:-

脂肪:3.34

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.54

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.87

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.30

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:51

前立腺:191.50

卵巣:111.80

精巣:51.90

心臓:25.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:33.90

肝臓:10.60

肺:48.90

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:53.30

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.33

胎盤:6.18

前立腺:5.98

卵巣:6.59

精巣:7.04

心臓:6.25

骨格筋:5.92

食道:5.96

胃:6.32

腸:6

結腸:6.04

肝臓:6.08

肺:6.60

膀胱:-

腎臓:6.35

下垂体:7.01

甲状腺:7.07

副腎:6.57

膵臓:6.47

乳腺:6.63

唾液腺:6.66

CAGE

子宮:3.76

胎盤:2.93

前立腺:3.85

卵巣:4.12

精巣:3.94

心臓:3.72

骨格筋:3.33

食道:3.31

胃:-

腸:3.14

結腸:3.22

肝臓:3.16

肺:3.95

膀胱:3.98

腎臓:3.04

下垂体:4.04

甲状腺:3.97

副腎:-

膵臓:3.67

乳腺:4.35

唾液腺:3.80

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.09

卵巣:4.79

精巣:4.46

心臓:3.26

骨格筋:4.62

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.16

肝臓:1.23

肺:4.87

膀胱:-

腎臓:2.80

下垂体:-

甲状腺:4.49

副腎:4.16

膵臓:-

乳腺:3.13

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_024165
Gene ID	5252
Unigene ID	Hs.166204
Probe set ID	202928_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000112511 ENSG00000225553
GTEx ID	ENSG00000112511 ENSG00000225553

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009343
ラット[1]	NM_212538

染色体

6p21.32 [33,378,176 - 33,384,230]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_QBL [33,306,984 - 33,307,829]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_SSTO [33,517,537 - 33,523,618]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002999	Tudor domain
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0006974	response to DNA damage stimulus
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0035098	ESC/E(Z) complex
GO:0005815	microtubule organizing center
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0035064	methylated histone residue binding
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008270	zinc ion binding

PHD finger protein 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function