phytanoyl-CoA 2-hydroxylase

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同義遺伝子名

LN1, PAHX, Phytanoyl-CoA alpha-hydroxylase, PhyH, LNAP1, PHYH1, PHYH, phytanoyl-CoA 2-hydroxylase, phytanoyl-CoA hydroxylase (Refsum disease), Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal precursor, Phytanic acid oxidase, phytanoyl-CoA hydroxylase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:19 小脳:- 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:82.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:38.70 骨髄:- 脂肪:80.70 骨:- 皮膚:43.20
GeneChip 大脳:6.33 小脳:6.39 脳幹:6.61 脳梁:5.86 松果体:- 末梢神経:6.87 脊柱:6.23 網膜:- 目:- 動脈:7.07 静脈:7.24 リンパ節:5.29 末梢血:- 脾臓:5.78 胸腺:5.24 骨髄:4.58 脂肪:7.46 骨:- 皮膚:6.62
CAGE 大脳:2.70 小脳:- 脳幹:2.79 脳梁:2.72 松果体:2.86 末梢神経:- 脊柱:2.61 網膜:- 目:- 動脈:3.15 静脈:2.62 リンパ節:2.26 末梢血:- 脾臓:2.14 胸腺:1.67 骨髄:- 脂肪:3.34 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.36 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.15 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.84 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:21.90 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:30.30 心臓:25.50 骨格筋:80.40 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:25.40     肝臓:84.40        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:83.20 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:101.60 膵臓:71.10 乳腺:74.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.65 胎盤:5.92 前立腺:7.12 卵巣:6.46 精巣:6.39 心臓:8.09 骨格筋:10.08 食道:7.04 胃:6.78 腸:7.64 結腸:6.96 肝臓:10.33 肺:6.23 膀胱:- 腎臓:9.32 下垂体:7.01 甲状腺:7.98 副腎:8.30 膵臓:6.61 乳腺:6.55 唾液腺:6.99
CAGE 子宮:2.37 胎盤:2.45 前立腺:2.88 卵巣:2.97 精巣:2.57 心臓:3.80 骨格筋:4.47 食道:2.92 胃:- 腸:3.69 結腸:3.28     肝臓:5.29    肺:2.95 膀胱:3.00 腎臓:3.82 下垂体:2.50 甲状腺:3.47 副腎:- 膵臓:3.13 乳腺:3.16 唾液腺:2.46
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.13 卵巣:4.68 精巣:4.27 心臓:6.01 骨格筋:7.26 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.61     肝臓:5.72        肺:3.57    膀胱:- 腎臓:5.58 下垂体:- 甲状腺:6.11 副腎:3.53 膵臓:- 乳腺:5.40 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006214
Gene ID 5264
Unigene ID Hs.498732
Probe set ID 203335_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000107537
GTEx ID ENSG00000107537

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_010726
ラット[1]  NM_053674

染色体

10p13  [13,319,796  -  13,344,412]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2433405
8954107
9221344
9266377
9326939
9326940
9565335
10051602
10588950
10686344
10709665
10744784
10767344
10866807
11549466
11555634
11574539
12477932
12767919
12923223
14974078
15489334
15930519
16169070
16186124
16189514
16385451
16756494
17353931
18612766
19322201
19834535
20301317
20301527
20877624
21832049
21890473
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0044255  cellular lipid metabolic process
GO:0001561  fatty acid alpha-oxidation
GO:0006720  isoprenoid metabolic process

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0005782  peroxisomal matrix
GO:0005777  peroxisome

Molecular Function

GO:0048037  cofactor binding
GO:0009055  electron carrier activity
GO:0031418  L-ascorbic acid binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0048244  phytanoyl-CoA dioxygenase activity
GO:0005515  protein binding