polycystic kidney disease 1 (autosomal dominant)

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同義遺伝子名

Polycystin-1 precursor, PKD1, polycystic kidney disease 1 (autosomal dominant)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:65.20

小脳:352.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:445

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:152.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:50.60

末梢血:-

脾臓:113.40

胸腺:77.30

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:25.60

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:7.55

小脳:9.56

脳幹:7.12

脳梁:7.47

松果体:-

末梢神経:7.32

脊柱:7.06

網膜:-

目:-

動脈:7.99

静脈:7.08

リンパ節:7.01

末梢血:-

脾臓:6.87

胸腺:6.88

骨髄:6.35

脂肪:7.11

骨:-

皮膚:7.20

CAGE

nodata

RNA-seq

大脳:0.58

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.95

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:36.40

前立腺:-

卵巣:149.10

精巣:77.90

心臓:25.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:42.50

腸:32.40

結腸:59.40

肝臓:-

肺:68.40

膀胱:-

腎臓:72.80

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:97.80

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.58

胎盤:6.26

前立腺:6.86

卵巣:7.29

精巣:7.19

心臓:7.20

骨格筋:7.17

食道:7.04

胃:7.09

腸:6.85

結腸:6.94

肝臓:6.90

肺:7.34

膀胱:-

腎臓:6.70

下垂体:8.69

甲状腺:6.84

副腎:7.08

膵臓:6.44

乳腺:7.66

唾液腺:6.92

CAGE

nodata

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.68

卵巣:1.98

精巣:1.14

心臓:0.66

骨格筋:3.09

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.29

肝臓:0.30

肺:0.77

膀胱:-

腎臓:1.33

下垂体:-

甲状腺:1.14

副腎:2.00

膵臓:-

乳腺:0.87

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000296
Gene ID	5310
Unigene ID	Hs.75813
Probe set ID	202328_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000008710
GTEx ID	ENSG00000008710

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_013630
ラット[1]	NM_013630

染色体

16p13.3 [2,138,711 - 2,185,899]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001304	C-type lectin
IPR016187	C-type lectin fold
IPR016186	C-type lectin-like
IPR002889	Carbohydrate-binding WSC
IPR013994	Carbohydrate-binding WSC, subgroup
IPR014010	Egg jelly receptor, REJ-like
IPR008976	Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2
IPR001024	Lipoxygenase, LH2

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009653	anatomical structure morphogenesis
GO:0048754	branching morphogenesis of a tube
GO:0070588	calcium ion transmembrane transport
GO:0007161	calcium-independent cell-matrix adhesion
GO:0001502	cartilage condensation
GO:0051216	cartilage development
GO:0007050	cell cycle arrest
GO:0007160	cell-matrix adhesion
GO:0042994	cytoplasmic sequestering of transcription factor
GO:0050982	detection of mechanical stimulus
GO:0001892	embryonic placenta development
GO:0048806	genitalia development
GO:0048565	gut development
GO:0007507	heart development
GO:0007156	homophilic cell adhesion
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0007259	JAK-STAT cascade
GO:0001822	kidney development
GO:0001889	liver development
GO:0060428	lung epithelium development
GO:0021915	neural tube development
GO:0007218	neuropeptide signaling pathway
GO:0006807	nitrogen compound metabolic process
GO:0018105	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0060674	placenta blood vessel development
GO:0031659	positive regulation of cyclin-dependent protein kinase activity during G1/S
GO:0032092	positive regulation of protein binding
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006611	protein export from nucleus
GO:0060236	regulation of mitotic spindle organization
GO:0043588	skin development
GO:0021510	spinal cord development

Cellular Component

GO:0016323	basolateral plasma membrane
GO:0005929	cilium
GO:0005737	cytoplasm
GO:0016021	integral to membrane
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0031512	motile primary cilium
GO:0005634	nucleus
GO:0002133	polycystin complex

Molecular Function

GO:0005262	calcium channel activity
GO:0030246	carbohydrate binding
GO:0005261	cation channel activity
GO:0005515	protein binding
GO:0019904	protein domain specific binding
GO:0019901	protein kinase binding

polycystic kidney disease 1 (autosomal dominant)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function