plakophilin 1 (ectodermal dysplasia/skin fragility syndrome)

詳細情報を見る

同義遺伝子名

PKP1, Plakophilin-1, Band-6 protein, B6P, MGC138829

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:111.70

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:77.30

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:225.60

GeneChip

大脳:4.90

小脳:4.75

脳幹:4.87

脳梁:4.79

松果体:-

末梢神経:4.91

脊柱:4.74

網膜:-

目:-

動脈:4.99

静脈:4.92

リンパ節:4.84

末梢血:-

脾臓:4.53

胸腺:4.80

骨髄:4.94

脂肪:5.06

骨:-

皮膚:5.76

CAGE

大脳:0.34

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:2.87

末梢神経:-

脊柱:0.13

網膜:-

目:-

動脈:1.38

静脈:2.33

リンパ節:2.63

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:3.36

骨髄:-

脂肪:3.66

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.12

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.75

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.91

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:21.90

前立腺:157.70

卵巣:-

精巣:-

心臓:166

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:42.40

肝臓:10.60

肺:48.90

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.69

胎盤:4.63

前立腺:4.90

卵巣:4.35

精巣:4.63

心臓:4.88

骨格筋:5.08

食道:6.55

胃:4.67

腸:4.83

結腸:4.93

肝臓:4.86

肺:4.31

膀胱:-

腎臓:4.71

下垂体:4.91

甲状腺:4.54

副腎:4.78

膵臓:5.40

乳腺:4.70

唾液腺:5.01

CAGE

子宮:3.16

胎盤:1.92

前立腺:2.69

卵巣:0.14

精巣:0.45

心臓:0.55

骨格筋:2.11

食道:5.65

胃:-

腸:0.48

結腸:0.60

肝臓:0

肺:2.03

膀胱:1.75

腎臓:0.15

下垂体:0.10

甲状腺:0.06

副腎:-

膵臓:0

乳腺:3.27

唾液腺:2.57

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.68

卵巣:0.04

精巣:0.27

心臓:0.42

骨格筋:0.48

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.89

肝臓:0

肺:2.01

膀胱:-

腎臓:0.36

下垂体:-

甲状腺:0.57

副腎:1.11

膵臓:-

乳腺:2.52

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001005337
Gene ID	5317
Unigene ID	Hs.497350
Probe set ID	205724_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000081277
GTEx ID	ENSG00000081277

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_019645
ラット[1]	NM_001107181

染色体

1q32.1 [201,252,580 - 201,302,121]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006915	apoptosis
GO:0007155	cell adhesion
GO:0006921	cell structure disassembly during apoptosis
GO:0045110	intermediate filament bundle assembly
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0007165	signal transduction

Cellular Component

GO:0030057	desmosome
GO:0005882	intermediate filament
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0019215	intermediate filament binding
GO:0005521	lamin binding
GO:0005515	protein binding
GO:0004871	signal transducer activity
GO:0030280	structural constituent of epidermis

plakophilin 1 (ectodermal dysplasia/skin fragility syndrome)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function