procollagen-lysine 1, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1

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同義遺伝子名

LH1, LH, LLH, PLOD, Lysyl hydroxylase 1, PLOD1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:138.70

小脳:75.60

脳幹:-

脳梁:1020.60

松果体:-

末梢神経:184

脊柱:112.30

網膜:-

目:123.40

動脈:989.20

静脈:399.90

リンパ節:30.30

末梢血:364.40

脾臓:283.60

胸腺:193.30

骨髄:39.40

脂肪:161.30

骨:754.90

皮膚:302.40

GeneChip

大脳:6.77

小脳:6.20

脳幹:6.76

脳梁:6.85

松果体:-

末梢神経:7.43

脊柱:6.71

網膜:-

目:-

動脈:7.52

静脈:7.28

リンパ節:6.79

末梢血:-

脾臓:6.54

胸腺:5.60

骨髄:6.56

脂肪:7.27

骨:-

皮膚:6.86

CAGE

大脳:3.43

小脳:-

脳幹:3.64

脳梁:3.64

松果体:3.42

末梢神経:-

脊柱:3.47

網膜:-

目:-

動脈:4.21

静脈:3.39

リンパ節:3.36

末梢血:-

脾臓:3.84

胸腺:1.49

骨髄:-

脂肪:4.00

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.02

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.70

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.51

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:255.20

胎盤:207.70

前立腺:202.80

卵巣:149.10

精巣:103.80

心臓:140.50

骨格筋:40.20

食道:-

胃:21.20

腸:226.80

結腸:76.30

肝臓:52.80

肺:200.40

膀胱:628.10

腎臓:249.50

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:203.10

膵臓:53.30

乳腺:241.60

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:7.97

胎盤:7.67

前立腺:7.14

卵巣:7.59

精巣:6.44

心臓:7.54

骨格筋:6.92

食道:6.69

胃:7.16

腸:7.22

結腸:7.24

肝臓:7.78

肺:7.44

膀胱:-

腎臓:7.57

下垂体:7.03

甲状腺:7.29

副腎:7.14

膵臓:6.91

乳腺:7.44

唾液腺:7.53

CAGE

子宮:4.07

胎盤:4.29

前立腺:3.91

卵巣:4.26

精巣:3.24

心臓:4.02

骨格筋:3.35

食道:3.63

胃:-

腸:3.82

結腸:3.90

肝臓:4.57

肺:3.68

膀胱:3.60

腎臓:4.08

下垂体:3.28

甲状腺:4.26

副腎:-

膵臓:4.11

乳腺:4.32

唾液腺:4.29

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.85

卵巣:5.17

精巣:4.45

心臓:3.66

骨格筋:3.34

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.05

肝臓:5.14

肺:4.05

膀胱:-

腎臓:4.54

下垂体:-

甲状腺:5.92

副腎:4.68

膵臓:-

乳腺:4.63

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000302
Gene ID	5351
Unigene ID	Hs.75093
Probe set ID	200827_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000083444
GTEx ID	ENSG00000083444

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_011122
ラット[1]	NM_011122

染色体

1p36.22 [11,994,262 - 12,035,599]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123	Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620	Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit

GO:0008544	epidermis development
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0046947	hydroxylysine biosynthetic process
GO:0055114	oxidation reduction
GO:0006464	protein modification process
GO:0001666	response to hypoxia

GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0030867	rough endoplasmic reticulum membrane

GO:0005506	iron ion binding
GO:0031418	L-ascorbic acid binding
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008475	procollagen-lysine 5-dioxygenase activity
GO:0042803	protein homodimerization activity

procollagen-lysine 1, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function