pleiotropic regulator 1 (PRL1 homolog, Arabidopsis)

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同義遺伝子名

MGC110980, Pleiotropic regulator 1, PLRG1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:125.60

小脳:277.10

脳幹:-

脳梁:204.10

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:58.80

動脈:329.70

静脈:266.60

リンパ節:91

末梢血:91.10

脾臓:56.70

胸腺:90.20

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:25.60

皮膚:91.20

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.76

小脳:-

脳幹:4.04

脳梁:3.87

松果体:3.31

末梢神経:-

脊柱:4.29

網膜:-

目:-

動脈:3.11

静脈:3.40

リンパ節:3.49

末梢血:-

脾臓:3.57

胸腺:3.57

骨髄:-

脂肪:3.70

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.22

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.74

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.13

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:105.60

前立腺:67.60

卵巣:-

精巣:82.20

心臓:38.30

骨格筋:60.30

食道:-

胃:127.50

腸:162

結腸:33.90

肝臓:42.20

肺:48.90

膀胱:125.60

腎臓:114.40

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:71.10

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.85

胎盤:3.46

前立腺:3.66

卵巣:3.82

精巣:3.39

心臓:3.22

骨格筋:3.10

食道:3.64

胃:-

腸:3.72

結腸:3.26

肝臓:4.04

肺:3.29

膀胱:3.57

腎臓:3.85

下垂体:3.60

甲状腺:3.69

副腎:-

膵臓:3.16

乳腺:2.87

唾液腺:3.59

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.08

卵巣:4.27

精巣:4.16

心臓:3.12

骨格筋:2.75

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.53

肝臓:3.50

肺:2.50

膀胱:-

腎臓:3.82

下垂体:-

甲状腺:4.38

副腎:3.88

膵臓:-

乳腺:3.66

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002669
Gene ID	5356
Unigene ID	Hs.249996
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000171566
GTEx ID	ENSG00000171566

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_016784
ラット [0]

染色体

4q31.3 [155,456,158 - 155,471,587]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472	G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0007165	signal transduction

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0004871	signal transducer activity
GO:0003714	transcription corepressor activity

pleiotropic regulator 1 (PRL1 homolog, Arabidopsis)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function