PMS1 postmeiotic segregation increased 1 (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

HNPCC3, DKFZp781M0253, PMS1 protein homolog 1, DNA mismatch repair protein PMS1, PMSL1, hPMS1, PMS1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:73.50 小脳:75.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:118.60 目:64.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:151.70 末梢血:54.70 脾臓:- 胸腺:103.10 骨髄:39.40 脂肪:121 骨:76.80 皮膚:24
GeneChip 大脳:6.08 小脳:6.61 脳幹:6.17 脳梁:6.40 松果体:- 末梢神経:6.16 脊柱:6.04 網膜:- 目:- 動脈:5.83 静脈:5.91 リンパ節:6.77 末梢血:- 脾臓:6.66 胸腺:6.92 骨髄:5.78 脂肪:6.19 骨:- 皮膚:5.91
CAGE 大脳:2.58 小脳:- 脳幹:2.68 脳梁:2.20 松果体:3.14 末梢神経:- 脊柱:2.59 網膜:- 目:- 動脈:1.72 静脈:2.16 リンパ節:2.10 末梢血:- 脾臓:2.44 胸腺:2.32 骨髄:- 脂肪:2.43 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:10.90 前立腺:- 卵巣:74.50 精巣:151.40 心臓:51.10 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:8.50     肝臓:63.30        肺:34.20    膀胱:251.20 腎臓:52 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.97 胎盤:5.44 前立腺:6.70 卵巣:6.86 精巣:8.76 心臓:5.94 骨格筋:5.45 食道:5.78 胃:6.33 腸:5.89 結腸:4.86 肝臓:6.55 肺:6.23 膀胱:- 腎臓:5.37 下垂体:6.30 甲状腺:6.56 副腎:6.40 膵臓:5.45 乳腺:6 唾液腺:5.84
CAGE 子宮:2.44 胎盤:1.79 前立腺:2.26 卵巣:2.57 精巣:3.46 心臓:2.04 骨格筋:1.89 食道:2.28 胃:- 腸:1.89 結腸:1.71     肝臓:1.79    肺:2.07 膀胱:2.20 腎臓:2.05 下垂体:2.90 甲状腺:2.17 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:2.19 唾液腺:1.82
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0.17 精巣:0 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.22 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.21 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001128144
Gene ID 5378
Unigene ID Hs.111749
Probe set ID 213677_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000064933
GTEx ID ENSG00000064933

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_153556
ラット[1]  NM_153556

染色体

2q32.2  [190,648,811  -  190,742,355]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7980603
8072530
8128251
8666228
8889548
9500994
10459502
10480359
10748159
10828585
11292842
11809883
11999575
12477932
12799449
15226443
15856462
16136382
16774946
17148452
17494052
18364438
18484899
18676680
18723338
19012493
19064572
19115210
19170196
19237606
19430479
19609347
19625176
19692168
20004149
20301390
20414254
20496165
20603015
20603073
21906983
22589738
23251661
23608172
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006200  ATP catabolic process
GO:0006298  mismatch repair
GO:0007131  reciprocal meiotic recombination

Cellular Component

GO:0032300  mismatch repair complex
GO:0032389  MutLalpha complex
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0016887  ATPase activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0030983  mismatched DNA binding
GO:0032407  MutSalpha complex binding
GO:0003697  single-stranded DNA binding