paired related homeobox 1

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同義遺伝子名

paired related homeobox 1, paired mesoderm homeo box 1, Paired mesoderm homeobox protein 1, PRX1, PMX1, PRRX1, PRX-1, Paired-related homeobox protein 1, Homeobox protein PHOX1, PHOX1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:17.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:153.40 脊柱:224.60 網膜:355.90 目:58.80 動脈:89.90 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:39.40 脂肪:80.70 骨:115.20 皮膚:62.40
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.78 小脳:- 脳幹:2.92 脳梁:3.19 松果体:2.46 末梢神経:- 脊柱:3.34 網膜:- 目:- 動脈:4.31 静脈:4.33 リンパ節:3.69 末梢血:- 脾臓:1.54 胸腺:2.76 骨髄:- 脂肪:5.01 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:5.48 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:173.20 胎盤:10.90 前立腺:180.20 卵巣:74.50 精巣:26 心臓:229.90 骨格筋:80.40 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:14.70    膀胱:125.60 腎臓:10.40 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:5.02 胎盤:2.39 前立腺:4.11 卵巣:4.48 精巣:3.85 心臓:4.34 骨格筋:5.18 食道:3.63 胃:- 腸:1.15 結腸:2.51     肝臓:0.63    肺:3.38 膀胱:4.20 腎臓:1.40 下垂体:1.95 甲状腺:3.99 副腎:- 膵臓:1.74 乳腺:4.31 唾液腺:2.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.51 卵巣:3.75 精巣:4.44 心臓:2.45 骨格筋:5.11 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.80     肝臓:0.00        肺:3.00    膀胱:- 腎臓:0.37 下垂体:- 甲状腺:3.67 副腎:4.25 膵臓:- 乳腺:4.01 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006902
Gene ID 5396
Unigene ID Hs.283416
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000116132
GTEx ID ENSG00000116132

オーソログ対応遺伝子

マウス[10]  NM_001025570, NM_011127, NM_175686
ラット [0]  

染色体

1q24.2  [170,631,869  -  170,708,560]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1509260
7760827
8125298
9334314
10397741
10737800
11036080
11063257
11463719
12477932
12539042
15489334
16582099
16710414
18029348
18296734
18604245
18978678
20301702
20634891
21323949
22198066
22544366
22566498
23201163
23807160

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048844  artery morphogenesis
GO:0051216  cartilage development
GO:0048701  embryonic cranial skeleton morphogenesis
GO:0030326  embryonic limb morphogenesis
GO:0042472  inner ear morphogenesis
GO:0042474  middle ear morphogenesis
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060021  palate development
GO:0002053  positive regulation of mesenchymal cell proliferation
GO:0045880  positive regulation of smoothened signaling pathway

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003713  transcription coactivator activity
GO:0003700  transcription factor activity