5'-3' exoribonuclease 1

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同義遺伝子名

DKFZp686F19113, Strand-exchange protein 1 homolog, DKFZp434P0721, 5'-3' exoribonuclease 1, XRN1, FLJ41903, DKFZp686B22225, SEP1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:17.80 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:118.60 目:41.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:80.90 末梢血:72.90 脾臓:- 胸腺:64.40 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:52.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.31 小脳:- 脳幹:3.31 脳梁:3.02 松果体:3.59 末梢神経:- 脊柱:3.64 網膜:- 目:- 動脈:3.34 静脈:3.18 リンパ節:3.45 末梢血:- 脾臓:3.67 胸腺:4.09 骨髄:- 脂肪:3.69 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.40 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.79 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:47.40 前立腺:33.80 卵巣:74.50 精巣:38.90 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:32.40 結腸:17     肝臓:21.10        肺:53.80    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:62.20 乳腺:176.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.72 胎盤:3.94 前立腺:3.48 卵巣:3.49 精巣:3.22 心臓:3.33 骨格筋:3.40 食道:3.46 胃:- 腸:4.06 結腸:3.31     肝臓:3.19    肺:3.63 膀胱:3.64 腎臓:3.07 下垂体:4.01 甲状腺:3.19 副腎:- 膵臓:2.54 乳腺:3.19 唾液腺:2.80
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.64 卵巣:2.63 精巣:2.63 心臓:2.19 骨格筋:3.01 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.08     肝臓:2.55        肺:3.05    膀胱:- 腎臓:2.21 下垂体:- 甲状腺:2.87 副腎:2.63 膵臓:- 乳腺:2.55 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001042604
Gene ID 54464
Unigene ID Hs.435103
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000114127
GTEx ID ENSG00000114127

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011916
ラット[1]  NM_011916

染色体

3q23  [142,025,449  -  142,166,904]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9049243
9802570
11329013
12426100
12477932
12515382
14527413
14580940
14702039
15231747
15489334
17081983
17148452
17314511
17545563
18029348
18172165
18423202
19946888
20020773
21139048
21145460
21890473
21906983
22505724
22586326
23142987
23248316
23471000
23517755
24163370
24332808
24457600
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0071044  histone mRNA catabolic process
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0071028  nuclear mRNA surveillance
GO:0000956  nuclear-transcribed mRNA catabolic process
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0016075  rRNA catabolic process

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000932  cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005829  cytosol
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0045111  intermediate filament cytoskeleton
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0008409  5'-3' exonuclease activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding