ataxia telangiectasia and Rad3 related

同義遺伝子名

SCKL1, FRP1, FRAP-related protein 1, Ataxia telangiectasia and Rad3-related protein, ATM/ATR, ataxia telangiectasia and Rad3 related, SCKL, Serine/threonine-protein kinase ATR, MEC1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:23.70

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:29.40

動脈:30

静脈:-

リンパ節:111.20

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:25.80

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:67.20

GeneChip

大脳:5.85

小脳:5.19

脳幹:5.79

脳梁:5.68

松果体:-

末梢神経:6.53

脊柱:5.65

網膜:-

目:-

動脈:5.59

静脈:5.37

リンパ節:7.10

末梢血:-

脾臓:7.04

胸腺:7.47

骨髄:5.61

脂肪:6.06

骨:-

皮膚:6.13

CAGE

大脳:3.03

小脳:-

脳幹:3.06

脳梁:2.93

松果体:3.52

末梢神経:-

脊柱:3.09

網膜:-

目:-

動脈:2.86

静脈:2.73

リンパ節:3.18

末梢血:-

脾臓:3.13

胸腺:3.30

骨髄:-

脂肪:2.91

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.83

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.79

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.65

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:18.20

前立腺:11.30

卵巣:74.50

精巣:47.60

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:106.20

腸:-

結腸:84.80

肝臓:63.30

肺:44

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:97.80

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.60

胎盤:5.43

前立腺:6.72

卵巣:6.52

精巣:6.79

心臓:5.43

骨格筋:5.02

食道:5.73

胃:5.82

腸:5.62

結腸:4.69

肝臓:6.10

肺:5.95

膀胱:-

腎臓:5.45

下垂体:6.30

甲状腺:6.65

副腎:7.54

膵臓:5.23

乳腺:6.40

唾液腺:5.75

CAGE

子宮:3.13

胎盤:2.36

前立腺:2.86

卵巣:2.75

精巣:3.36

心臓:2.67

骨格筋:2.24

食道:2.67

胃:-

腸:2.63

結腸:2.60

肝臓:2.93

肺:2.95

膀胱:2.68

腎臓:2.88

下垂体:3.53

甲状腺:2.73

副腎:-

膵臓:2.71

乳腺:2.87

唾液腺:3.11

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.63

卵巣:2.38

精巣:2.66

心臓:1.26

骨格筋:1.19

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.17

肝臓:1.38

肺:1.30

膀胱:-

腎臓:1.94

下垂体:-

甲状腺:2.49

副腎:2.20

膵臓:-

乳腺:2.24

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001184
Gene ID	545
Unigene ID	Hs.271791
Probe set ID	209903_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000175054
GTEx ID	ENSG00000175054

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_019864
ラット[1]	NM_019864

染色体

3q23 [142,168,077 - 142,297,668]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000403	Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic
IPR014009	PIK-related kinase
IPR011009	Protein kinase-like domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007049	cell cycle
GO:0071480	cellular response to gamma radiation
GO:0034644	cellular response to UV
GO:0000077	DNA damage checkpoint
GO:0006281	DNA repair
GO:0006260	DNA replication
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0008156	negative regulation of DNA replication
GO:0018105	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0043517	positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
GO:0046777	protein amino acid autophosphorylation
GO:0043393	regulation of protein binding
GO:0006974	response to DNA damage stimulus

Cellular Component

GO:0005694	chromosome
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0016605	PML body
GO:0001741	XY body

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0032405	MutLalpha complex binding
GO:0032407	MutSalpha complex binding
GO:0005515	protein binding
GO:0004672	protein kinase activity
GO:0004674	protein serine/threonine kinase activity

ataxia telangiectasia and Rad3 related

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function