coiled-coil alpha-helical rod protein 1

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同義遺伝子名

Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, Putative gene 8 protein, chromosome 6 open reading frame 18, MGC126372, MGC126371, Alpha helical coiled-coil rod protein, C6orf18, CCHCR1, coiled-coil alpha-helical rod protein 1, Pg8

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:37.90 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:20.20 末梢血:18.20 脾臓:56.70 胸腺:231.90 骨髄:19.70 脂肪:80.70 骨:12.80 皮膚:33.60
GeneChip 大脳:3.98 小脳:4.11 脳幹:3.95 脳梁:4.03 松果体:- 末梢神経:4.03 脊柱:3.91 網膜:- 目:- 動脈:3.99 静脈:4.06 リンパ節:4.17 末梢血:- 脾臓:4.12 胸腺:3.94 骨髄:4.18 脂肪:4.10 骨:- 皮膚:4.08
CAGE 大脳:1.17 小脳:- 脳幹:1.25 脳梁:1.04 松果体:1.38 末梢神経:- 脊柱:1.07 網膜:- 目:- 動脈:1.10 静脈:1.03 リンパ節:0.85 末梢血:- 脾臓:0.95 胸腺:1.24 骨髄:- 脂肪:0.46 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.24 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.97 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.05 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:3.60 前立腺:11.30 卵巣:74.50 精巣:142.80 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:64.80 結腸:67.80     肝臓:21.10        肺:9.80    膀胱:125.60 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.13 胎盤:3.73 前立腺:4.02 卵巣:4.44 精巣:6.61 心臓:4.05 骨格筋:4.12 食道:4.23 胃:4.30 腸:4.31 結腸:4.46 肝臓:4.24 肺:3.98 膀胱:- 腎臓:4.28 下垂体:3.87 甲状腺:4.30 副腎:3.95 膵臓:4.01 乳腺:4.09 唾液腺:4.28
CAGE 子宮:1.35 胎盤:0.59 前立腺:1.36 卵巣:0.86 精巣:3.37 心臓:0.80 骨格筋:1.15 食道:0.94 胃:- 腸:1.29 結腸:1.71     肝臓:0.90    肺:0.97 膀胱:0.83 腎臓:1.03 下垂体:1.17 甲状腺:1.09 副腎:- 膵臓:1.74 乳腺:0.55 唾液腺:1.39
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.10 卵巣:2.61 精巣:2.32 心臓:1.15 骨格筋:2.48 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.48     肝臓:0.82        肺:1.54    膀胱:- 腎臓:1.83 下垂体:- 甲状腺:2.10 副腎:1.69 膵臓:- 乳腺:1.96 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_019052
Gene ID 54535
Unigene ID Hs.485075
Probe set ID 37425_g_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000204536
GTEx ID ENSG00000204536

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_146248
ラット[1]  NM_146248

染色体

6p21.33  [31,110,216  -  31,126,015]
HSCHR6_MHC_QBL  [31,102,653  -  31,118,444]
HSCHR6_MHC_MANN  [31,155,177  -  31,170,971]
HSCHR6_MHC_MCF  [31,188,755  -  31,204,550]
HSCHR6_MHC_DBB  [31,103,949  -  31,119,721]
HSCHR6_MHC_COX  [31,102,772  -  31,118,543]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7566098
10545595
10888604
11348465
11875053
12023963
12477932
12909641
14675183
14702039
15146197
15214895
15539411
15654960
16141233
16713569
17179747
17221218
17340018
17530646
18029348
18174193
18305892
19242354
19551138
19851445
19915573
20379614
21139048
21738480
21743467
21810746
21890473
21906983
21912425
21988832
22182809
23144326
23189171
23263863
23955597
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0006611  protein export from nucleus

Cellular Component

GO:0005814  centriole
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005634  nucleus