egl nine homolog 1 (C. elegans)

同義遺伝子名

Egl nine homolog 1, egl nine homolog 1 (C. elegans), SM20, PNAS-118, HPH-2, Prolyl hydroxylase domain-containing protein 2, EGLN1, PHD2, Hypoxia-inducible factor prolyl hydroxylase 2, EGL nine (C.elegans) homolog 1, ECYT3, SM-20, HIFPH2, PNAS-137, HIF-prolyl hydroxylase 2, ZMYND6, HIF-PH2, C1orf12, DKFZp761F179

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:62.80

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:148.30

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:58.80

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:30.30

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:90.20

骨髄:78.70

脂肪:-

骨:38.40

皮膚:62.40

GeneChip

大脳:5.41

小脳:5.47

脳幹:5.35

脳梁:5.41

松果体:-

末梢神経:5.46

脊柱:5.51

網膜:-

目:-

動脈:5.46

静脈:5.79

リンパ節:5.49

末梢血:-

脾臓:5.95

胸腺:5.61

骨髄:5.61

脂肪:5.63

骨:-

皮膚:5.45

CAGE

大脳:3.64

小脳:-

脳幹:3.76

脳梁:3.82

松果体:3.24

末梢神経:-

脊柱:3.77

網膜:-

目:-

動脈:3.81

静脈:3.54

リンパ節:3.32

末梢血:-

脾臓:3.62

胸腺:3.35

骨髄:-

脂肪:4.53

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.91

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.95

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.89

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:7.30

前立腺:90.10

卵巣:37.30

精巣:56.20

心臓:12.80

骨格筋:100.50

食道:-

胃:63.70

腸:32.40

結腸:59.40

肝臓:52.80

肺:44

膀胱:-

腎臓:176.80

下垂体:232

甲状腺:163.70

副腎:50.80

膵臓:88.90

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.50

胎盤:5.39

前立腺:5.31

卵巣:5.25

精巣:5.24

心臓:6.64

骨格筋:7.22

食道:5.78

胃:5.57

腸:6.32

結腸:5.72

肝臓:5.84

肺:5.33

膀胱:-

腎臓:5.65

下垂体:5.44

甲状腺:5.14

副腎:5.77

膵臓:5.63

乳腺:5.41

唾液腺:5.29

CAGE

子宮:3.64

胎盤:3.40

前立腺:3.81

卵巣:4.02

精巣:3.64

心臓:4.21

骨格筋:5.52

食道:4.03

胃:-

腸:4.26

結腸:3.95

肝臓:4.51

肺:3.53

膀胱:4.01

腎臓:3.83

下垂体:3.54

甲状腺:3.70

副腎:-

膵臓:3.75

乳腺:4.31

唾液腺:3.17

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.00

卵巣:3.99

精巣:3.80

心臓:4.88

骨格筋:7.08

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.08

肝臓:3.68

肺:2.62

膀胱:-

腎臓:3.85

下垂体:-

甲状腺:4.68

副腎:3.17

膵臓:-

乳腺:3.77

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_022051
Gene ID	54583
Unigene ID	Hs.444450
Probe set ID	221497_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000135766
GTEx ID	ENSG00000135766

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_053207
ラット[2]	NM_053207

染色体

1q42.2 [231,499,497 - 231,560,790]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123	Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620	Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0055008	cardiac muscle tissue morphogenesis
GO:0071456	cellular response to hypoxia
GO:0060347	heart trabecula formation
GO:0060711	labyrinthine layer development
GO:0030821	negative regulation of cAMP catabolic process
GO:0051344	negative regulation of cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity
GO:0043433	negative regulation of transcription factor activity
GO:0032364	oxygen homeostasis
GO:0018401	peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline
GO:0045765	regulation of angiogenesis
GO:0001666	response to hypoxia
GO:0060412	ventricular septum morphogenesis

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0019899	enzyme binding
GO:0005506	iron ion binding
GO:0031418	L-ascorbic acid binding
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0031545	peptidyl-proline 4-dioxygenase activity
GO:0031543	peptidyl-proline dioxygenase activity
GO:0005515	protein binding

egl nine homolog 1 (C. elegans)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function