alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked (RAD54 homolog, S. cerevisiae)

同義遺伝子名

SHS, XNP, ATP-dependent helicase ATRX, MRXS3, ZNF-HX, Transcriptional regulator ATRX, RAD54L, ATRX, Znf-HX, X-linked helicase II, XH2, X-linked nuclear protein, ATR2, MGC2094, RAD54

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:87.70

小脳:63

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:148.30

末梢神経:153.40

脊柱:112.30

網膜:-

目:99.90

動脈:60

静脈:-

リンパ節:131.40

末梢血:36.40

脾臓:18.90

胸腺:38.70

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:64

皮膚:100.80

GeneChip

大脳:7.46

小脳:8.26

脳幹:7.21

脳梁:7.19

松果体:-

末梢神経:7.09

脊柱:7.26

網膜:-

目:-

動脈:7.10

静脈:7.07

リンパ節:7.31

末梢血:-

脾臓:7.51

胸腺:7.96

骨髄:6.45

脂肪:7.22

骨:-

皮膚:6.82

CAGE

大脳:4.09

小脳:-

脳幹:4.16

脳梁:3.18

松果体:4.56

末梢神経:-

脊柱:4.17

網膜:-

目:-

動脈:3.52

静脈:3.64

リンパ節:3.53

末梢血:-

脾臓:4.03

胸腺:4.10

骨髄:-

脂肪:3.85

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.66

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.54

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.63

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:100.20

胎盤:80.10

前立腺:90.10

卵巣:111.80

精巣:34.60

心臓:140.50

骨格筋:120.50

食道:-

胃:254.90

腸:-

結腸:101.80

肝臓:253.30

肺:117.30

膀胱:-

腎臓:145.60

下垂体:232

甲状腺:163.70

副腎:101.60

膵臓:204.50

乳腺:176.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.61

胎盤:6.58

前立腺:7.67

卵巣:7.51

精巣:5.52

心臓:7.27

骨格筋:7.31

食道:6.56

胃:7.02

腸:6.95

結腸:5.60

肝臓:6.19

肺:7.07

膀胱:-

腎臓:6.76

下垂体:7.59

甲状腺:7.38

副腎:7.19

膵臓:6.24

乳腺:7.13

唾液腺:6.84

CAGE

子宮:3.67

胎盤:3.41

前立腺:4.10

卵巣:4.02

精巣:2.92

心臓:3.99

骨格筋:3.64

食道:3.76

胃:-

腸:3.43

結腸:3.51

肝臓:3.02

肺:3.88

膀胱:4.10

腎臓:3.69

下垂体:4.36

甲状腺:3.56

副腎:-

膵臓:2.60

乳腺:3.86

唾液腺:2.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.33

卵巣:2.72

精巣:2.57

心臓:3.17

骨格筋:1.29

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.57

肝臓:0.40

肺:1.92

膀胱:-

腎臓:0.94

下垂体:-

甲状腺:2.97

副腎:2.32

膵臓:-

乳腺:2.19

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000489
Gene ID	546
Unigene ID	Hs.533526
Probe set ID	208861_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000085224
GTEx ID	ENSG00000085224

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]	NM_009530
ラット[5]	NM_009530

染色体

Xq21.1 [76,760,378 - 77,041,702]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0032508	DNA duplex unwinding
GO:0006306	DNA methylation
GO:0006310	DNA recombination
GO:0006281	DNA repair
GO:0030900	forebrain development
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005720	nuclear heterochromatin
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003682	chromatin binding
GO:0070087	chromo shadow domain binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003678	DNA helicase activity
GO:0004386	helicase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008270	zinc ion binding

alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked (RAD54 homolog, S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function