Paf1, RNA polymerase II associated factor, homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

PAF1, FLJ11123, PD2, F23149_1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:62.80

小脳:75.60

脳幹:-

脳梁:116.60

松果体:148.30

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:58.80

動脈:149.90

静脈:-

リンパ節:60.70

末梢血:127.50

脾臓:56.70

胸腺:116

骨髄:157.40

脂肪:121

骨:89.60

皮膚:52.80

GeneChip

大脳:6.42

小脳:6.32

脳幹:6.37

脳梁:6.70

松果体:-

末梢神経:6.27

脊柱:6.37

網膜:-

目:-

動脈:6.60

静脈:6.68

リンパ節:6.47

末梢血:-

脾臓:6.67

胸腺:6.41

骨髄:5.84

脂肪:6.21

骨:-

皮膚:6.39

CAGE

大脳:4.11

小脳:-

脳幹:4.20

脳梁:4.36

松果体:4.22

末梢神経:-

脊柱:4.20

網膜:-

目:-

動脈:3.86

静脈:3.87

リンパ節:3.92

末梢血:-

脾臓:4.11

胸腺:3.95

骨髄:-

脂肪:3.70

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.44

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.33

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.46

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:123.90

前立腺:67.60

卵巣:37.30

精巣:134.10

心臓:38.30

骨格筋:60.30

食道:-

胃:63.70

腸:356.40

結腸:84.80

肝臓:52.80

肺:48.90

膀胱:251.20

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:1637.50

副腎:50.80

膵臓:142.30

乳腺:102.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.39

胎盤:6.15

前立腺:6.64

卵巣:6.69

精巣:7.53

心臓:6.11

骨格筋:6.34

食道:6.80

胃:6.21

腸:5.92

結腸:5.89

肝臓:6.25

肺:6.55

膀胱:-

腎臓:6.18

下垂体:6.63

甲状腺:6.87

副腎:6.52

膵臓:6.29

乳腺:6.54

唾液腺:6.16

CAGE

子宮:4.00

胎盤:3.90

前立腺:4.09

卵巣:4.16

精巣:4.75

心臓:3.95

骨格筋:4.13

食道:4.02

胃:-

腸:3.74

結腸:3.67

肝臓:4.37

肺:3.86

膀胱:4.02

腎臓:3.89

下垂体:4.06

甲状腺:4.05

副腎:-

膵臓:3.54

乳腺:4.25

唾液腺:4.04

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.74

卵巣:5.06

精巣:5.57

心臓:3.48

骨格筋:4.16

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.43

肝臓:3.78

肺:4.40

膀胱:-

腎臓:4.23

下垂体:-

甲状腺:4.93

副腎:4.52

膵臓:-

乳腺:4.44

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_019088
Gene ID	54623
Unigene ID	Hs.466714
Probe set ID	202093_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000006712
GTEx ID	ENSG00000006712

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_019458
ラット[1]	NM_001024898

染色体

19q13.2 [39,876,275 - 39,881,757]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0071222	cellular response to lipopolysaccharide
GO:0001711	endodermal cell fate commitment
GO:0033523	histone H2B ubiquitination
GO:0010390	histone monoubiquitination
GO:0006378	mRNA polyadenylation
GO:0045638	negative regulation of myeloid cell differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0031442	positive regulation of mRNA 3'-end processing
GO:0032968	positive regulation of RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0019827	stem cell maintenance
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0016055	Wnt receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0016593	Cdc73/Paf1 complex
GO:0005739	mitochondrion
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0005515	protein binding

Paf1, RNA polymerase II associated factor, homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function