ataxin 2-binding protein 1

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同義遺伝子名

FOX1, ataxin 2-binding protein 1, HRNBP1, A2BP1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:318.80

小脳:591.90

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:355.90

目:129.30

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:59

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:9.03

小脳:8.99

脳幹:7.12

脳梁:5.79

松果体:-

末梢神経:8.39

脊柱:7.44

網膜:-

目:-

動脈:5.27

静脈:5.62

リンパ節:4.86

末梢血:-

脾臓:4.68

胸腺:4.69

骨髄:5.15

脂肪:4.90

骨:-

皮膚:5.18

CAGE

大脳:4.81

小脳:-

脳幹:3.22

脳梁:2.91

松果体:1.87

末梢神経:-

脊柱:3.21

網膜:-

目:-

動脈:0.87

静脈:1.29

リンパ節:0.74

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:2.57

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.54

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.11

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.02

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:21.90

前立腺:67.60

卵巣:111.80

精巣:30.30

心臓:51.10

骨格筋:261.20

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:245.90

肝臓:31.70

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.96

胎盤:4.85

前立腺:5.06

卵巣:5.22

精巣:5.03

心臓:7.50

骨格筋:9.12

食道:6.24

胃:4.82

腸:5.92

結腸:5.20

肝臓:4.82

肺:5.16

膀胱:-

腎臓:4.86

下垂体:5.20

甲状腺:4.80

副腎:4.69

膵臓:5.35

乳腺:4.90

唾液腺:4.78

CAGE

子宮:0.38

胎盤:0

前立腺:0.66

卵巣:0.32

精巣:0.35

心臓:3.62

骨格筋:5.32

食道:1.20

胃:-

腸:0.27

結腸:0.04

肝臓:0

肺:0

膀胱:0.69

腎臓:0.44

下垂体:0.83

甲状腺:0.60

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:1.00

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.20

卵巣:0.08

精巣:0.08

心臓:0.00

骨格筋:0.18

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.09

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0.12

下垂体:-

甲状腺:0.33

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.06

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001142334
Gene ID	54715
Unigene ID	Hs.459842
Probe set ID	221217_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000078328
GTEx ID	ENSG00000078328

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_021477, NM_183188
ラット[1]	NM_001106974, NM_183188

染色体

16p13.3 [6,069,095 - 7,763,340]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006397	mRNA processing
GO:0050885	neuromuscular process controlling balance
GO:0043484	regulation of RNA splicing
GO:0008380	RNA splicing
GO:0050658	RNA transport

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005802	trans-Golgi network

Molecular Function

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0003723	RNA binding

ataxin 2-binding protein 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function