solute carrier family 6 (proline IMINO transporter), member 20

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同義遺伝子名

Neurotransmitter transporter rB21A homolog, Solute carrier family 6 member 20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, SLC6A20, XT3, Xtrp3, SIT1, XTRP3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:4.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:118.60 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:3.58 小脳:3.45 脳幹:3.56 脳梁:3.56 松果体:- 末梢神経:3.78 脊柱:3.76 網膜:- 目:- 動脈:3.80 静脈:3.52 リンパ節:3.42 末梢血:- 脾臓:3.47 胸腺:3.48 骨髄:3.68 脂肪:3.51 骨:- 皮膚:3.58
CAGE 大脳:0.61 小脳:- 脳幹:0.82 脳梁:1.68 松果体:1.83 末梢神経:- 脊柱:1.22 網膜:- 目:- 動脈:0.18 静脈:0.34 リンパ節:0.06 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.23 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.46 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:37.30 精巣:- 心臓:- 骨格筋:20.10 食道:- 胃:85 腸:32.40 結腸:50.90     肝臓:10.60        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.46 胎盤:3.28 前立腺:3.37 卵巣:3.47 精巣:3.48 心臓:3.41 骨格筋:3.51 食道:3.56 胃:3.50 腸:3.80 結腸:3.61 肝臓:3.55 肺:3.45 膀胱:- 腎臓:3.61 下垂体:3.81 甲状腺:3.52 副腎:3.49 膵臓:3.62 乳腺:3.45 唾液腺:3.71
CAGE 子宮:0.62 胎盤:0.08 前立腺:0.08 卵巣:0.07 精巣:0.16 心臓:0.11 骨格筋:0.30 食道:0.26 胃:- 腸:3.67 結腸:1.47     肝臓:0.26    肺:0.51 膀胱:0 腎臓:1.67 下垂体:1.05 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:1.74 乳腺:0.90 唾液腺:0.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.06 卵巣:0.03 精巣:0.12 心臓:0 骨格筋:0.15 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.18    膀胱:- 腎臓:0.92 下垂体:- 甲状腺:0.17 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_020208
Gene ID 54716
Unigene ID Hs.413095
Probe set ID 219614_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000163817
GTEx ID ENSG00000163817

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_011731, NM_139142
ラット [0]  

染色体

3p21.31  [45,796,942  -  45,838,027]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000175  Sodium:neurotransmitter symporter
IPR002438  Sodium:neurotransmitter symporter, orphan

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9932288
11352561
12477932
15308626
15632147
18195088
19033659
19657969
21572414
22610502
23333304

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0003333  amino acid transmembrane transport
GO:0006865  amino acid transport
GO:0015816  glycine transport
GO:0006811  ion transport
GO:0015824  proline transport
GO:0055085  transmembrane transport

Cellular Component

GO:0016324  apical plasma membrane
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0015171  amino acid transmembrane transporter activity
GO:0005328  neurotransmitter:sodium symporter activity