gypsy retrotransposon integrase 1

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同義遺伝子名

FLJ20125

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:7.10

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:11.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:4.57

小脳:4.66

脳幹:4.72

脳梁:4.87

松果体:-

末梢神経:5.01

脊柱:4.66

網膜:-

目:-

動脈:4.72

静脈:4.78

リンパ節:4.56

末梢血:-

脾臓:4.73

胸腺:5.24

骨髄:4.62

脂肪:4.76

骨:-

皮膚:4.80

CAGE

大脳:2.29

小脳:-

脳幹:2.79

脳梁:2.34

松果体:2.76

末梢神経:-

脊柱:2.70

網膜:-

目:-

動脈:1.33

静脈:1.69

リンパ節:1.75

末梢血:-

脾臓:2.38

胸腺:2.39

骨髄:-

脂肪:2.01

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.51

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.40

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.74

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:36.40

前立腺:-

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:12.80

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:31.70

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:37.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.16

胎盤:4.60

前立腺:5.38

卵巣:5.26

精巣:5.52

心臓:5.26

骨格筋:5.81

食道:4.65

胃:4.66

腸:4.79

結腸:4.15

肝臓:4.79

肺:4.39

膀胱:-

腎臓:4.43

下垂体:4.76

甲状腺:4.87

副腎:4.69

膵臓:4.38

乳腺:4.91

唾液腺:4.53

CAGE

子宮:2.40

胎盤:2.00

前立腺:2.58

卵巣:2.59

精巣:2.39

心臓:2.11

骨格筋:1.85

食道:2.41

胃:-

腸:2.22

結腸:1.51

肝臓:2.19

肺:2.23

膀胱:2.58

腎臓:2.36

下垂体:2.99

甲状腺:2.52

副腎:-

膵臓:1.21

乳腺:1.92

唾液腺:1.58

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.05

卵巣:2.37

精巣:2.09

心臓:2.02

骨格筋:1.45

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.46

肝臓:1.15

肺:0.91

膀胱:-

腎臓:1.82

下垂体:-

甲状腺:2.14

副腎:1.33

膵臓:-

乳腺:1.44

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_017676
Gene ID	54826
Unigene ID	Hs.24088
Probe set ID	219467_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000145723
GTEx ID	ENSG00000145723

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_026250
ラット[1]	NM_001025012

染色体

5q21.1 [102,421,704 - 102,455,855]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001584	Integrase, catalytic core
IPR012337	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H fold

Link to Pubmed (Pubmed ID)

8125298
11470852
12477932
16189514
16344560
20379614
21906983

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

DNA integration

Molecular Function

nucleic acid binding