SNF related kinase

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同義遺伝子名

SNFRK, SNF related kinase, HSNFRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, DKFZp779A1866, SNRK, SNF1-related kinase, KIAA0096, FLJ20224

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:74.70 小脳:163.70 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:336.90 網膜:- 目:41.10 動脈:239.80 静脈:133.30 リンパ節:60.70 末梢血:36.40 脾臓:37.80 胸腺:180.40 骨髄:59 脂肪:80.70 骨:25.60 皮膚:38.40
GeneChip 大脳:7.61 小脳:9.12 脳幹:7.86 脳梁:6.74 松果体:- 末梢神経:8.06 脊柱:7.53 網膜:- 目:- 動脈:7.62 静脈:8.13 リンパ節:7.97 末梢血:- 脾臓:9.05 胸腺:9.29 骨髄:8.20 脂肪:8.53 骨:- 皮膚:8.64
CAGE 大脳:3.64 小脳:- 脳幹:3.43 脳梁:3.10 松果体:3.42 末梢神経:- 脊柱:3.45 網膜:- 目:- 動脈:3.86 静脈:4.02 リンパ節:3.75 末梢血:- 脾臓:4.14 胸腺:4.61 骨髄:- 脂肪:4.27 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.77 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.69 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.02 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:154.90 胎盤:72.90 前立腺:67.60 卵巣:- 精巣:26 心臓:63.90 骨格筋:40.20 食道:- 胃:63.70 腸:32.40 結腸:33.90     肝臓:52.80        肺:78.20    膀胱:- 腎臓:176.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:53.30 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.41 胎盤:7.84 前立腺:7.63 卵巣:7.86 精巣:7.24 心臓:8.19 骨格筋:7.48 食道:7.71 胃:7.93 腸:7.86 結腸:7.17 肝臓:7.50 肺:8.98 膀胱:- 腎臓:7.98 下垂体:7.32 甲状腺:8.15 副腎:7.42 膵臓:7.36 乳腺:8.26 唾液腺:6.56
CAGE 子宮:3.90 胎盤:3.39 前立腺:3.52 卵巣:3.68 精巣:3.69 心臓:3.66 骨格筋:3.33 食道:3.44 胃:- 腸:3.77 結腸:3.45     肝臓:3.17    肺:4.37 膀胱:3.73 腎臓:3.57 下垂体:3.74 甲状腺:3.70 副腎:- 膵臓:3.65 乳腺:3.99 唾液腺:2.66
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.67 卵巣:3.26 精巣:2.84 心臓:2.47 骨格筋:3.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.58     肝臓:2.47        肺:5.42    膀胱:- 腎臓:3.15 下垂体:- 甲状腺:3.73 副腎:3.59 膵臓:- 乳腺:3.54 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001100594
Gene ID 54861
Unigene ID Hs.476052
Probe set ID 209481_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000163788
GTEx ID ENSG00000163788

オーソログ対応遺伝子

マウス[8]  NM_001164572, NM_133741
ラット[8]  NM_001164572, NM_133741

染色体

3p22.1  [43,328,004  -  43,466,256]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000719  Protein kinase, catalytic domain
IPR011009  Protein kinase-like domain
IPR002290  Serine/threonine-protein kinase domain
IPR017442  Serine/threonine-protein kinase-like domain
IPR001245  Tyrosine-protein kinase, catalytic domain
IPR020635  Tyrosine-protein kinase, subgroup, catalytic domain
IPR000449  Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal
IPR015940  Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7788527
8654423
10878360
10930554
12087103
12168954
12234663
12477932
14702039
15342556
15489334
15733851
16306228
16344560
17353931
22874833
23251661
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030099  myeloid cell differentiation
GO:0006468  protein amino acid phosphorylation

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0000287  magnesium ion binding
GO:0004674  protein serine/threonine kinase activity