alkB, alkylation repair homolog 5 (E. coli)

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同義遺伝子名

ALKBH5, OFOXD1, alkB, alkylation repair homolog 5 (E. coli), Alkylated repair protein alkB homolog 5, OFOXD, FLJ20308

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:40.30 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:148.30 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:105.80 動脈:89.90 静脈:66.60 リンパ節:151.70 末梢血:36.40 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:59 脂肪:121 骨:102.40 皮膚:129.60
GeneChip nodata
CAGE 大脳:4.44 小脳:- 脳幹:4.33 脳梁:4.50 松果体:4.35 末梢神経:- 脊柱:4.22 網膜:- 目:- 動脈:4.68 静脈:4.16 リンパ節:4.11 末梢血:- 脾臓:4.40 胸腺:4.57 骨髄:- 脂肪:4.41 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.85 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.47 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.93 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:76.50 前立腺:101.40 卵巣:186.30 精巣:103.80 心臓:127.70 骨格筋:120.50 食道:- 胃:85 腸:32.40 結腸:76.30     肝臓:31.70        肺:44    膀胱:- 腎臓:239.10 下垂体:116 甲状腺:163.70 副腎:101.60 膵臓:133.40 乳腺:83.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:4.22 胎盤:4.10 前立腺:4.50 卵巣:4.52 精巣:4.99 心臓:4.82 骨格筋:5.09 食道:4.34 胃:- 腸:4.29 結腸:4.41     肝臓:4.48    肺:4.30 膀胱:4.76 腎臓:4.21 下垂体:4.44 甲状腺:4.55 副腎:- 膵臓:4.07 乳腺:4.76 唾液腺:4.37
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.34 卵巣:5.21 精巣:6.10 心臓:5.21 骨格筋:6.43 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.03     肝臓:4.41        肺:4.91    膀胱:- 腎臓:4.61 下垂体:- 甲状腺:5.17 副腎:4.65 膵臓:- 乳腺:4.76 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_017758
Gene ID 54890
Unigene ID Hs.462392
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000091542
GTEx ID ENSG00000091542

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_172943
ラット[1]  NM_172943

染色体

17p11.2  [18,086,392  -  18,113,268]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
11997338
12477932
14702039
15489334
19322201
21139048
21264265
21890473
22113938
23177736
23251661
24163370
24250222
24489119
24616105
24778178
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0006406  mRNA export from nucleus
GO:0006397  mRNA processing
GO:0001666  response to hypoxia
GO:0007283  spermatogenesis

Cellular Component

GO:0016607  nuclear speck
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen