sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C

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同義遺伝子名

Semacl1, MGC126383, M-Sema F, SEMAI, MGC126382, KIAA1739, Semaf, Semaphorin-4C precursor, SEMA4C, UNQ5855/PRO34487, FLJ20369, M-SEMA-F

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:30.80 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:41.10 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:36.40 脾臓:56.70 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:28.80
GeneChip 大脳:7.25 小脳:7.43 脳幹:7.21 脳梁:7.81 松果体:- 末梢神経:7.93 脊柱:7.43 網膜:- 目:- 動脈:7.55 静脈:7.59 リンパ節:7.11 末梢血:- 脾臓:8.11 胸腺:6.17 骨髄:6.89 脂肪:7.14 骨:- 皮膚:6.96
CAGE 大脳:2.68 小脳:- 脳幹:3.25 脳梁:3.62 松果体:2.25 末梢神経:- 脊柱:2.83 網膜:- 目:- 動脈:2.98 静脈:2.31 リンパ節:1.94 末梢血:- 脾臓:3.06 胸腺:1.03 骨髄:- 脂肪:2.05 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.22 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.41 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.31 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:40.10 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:60.30 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.60 胎盤:7.47 前立腺:7.21 卵巣:7.32 精巣:6.18 心臓:7.30 骨格筋:6.80 食道:7.29 胃:7.29 腸:7.11 結腸:7.31 肝臓:7.14 肺:7.44 膀胱:- 腎臓:6.88 下垂体:6.93 甲状腺:6.84 副腎:7.09 膵臓:7.45 乳腺:7.47 唾液腺:6.74
CAGE 子宮:3.04 胎盤:3.32 前立腺:3.19 卵巣:2.81 精巣:1.86 心臓:2.65 骨格筋:1.48 食道:2.65 胃:- 腸:1.86 結腸:2.59     肝臓:1.86    肺:2.49 膀胱:3.21 腎臓:1.81 下垂体:1.84 甲状腺:2.06 副腎:- 膵臓:1.59 乳腺:1.80 唾液腺:2.26
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.28 卵巣:3.54 精巣:2.52 心臓:1.63 骨格筋:1.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.61     肝臓:2.13        肺:3.88    膀胱:- 腎臓:2.13 下垂体:- 甲状腺:2.41 副腎:3.81 膵臓:- 乳腺:2.35 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_017789
Gene ID 54910
Unigene ID Hs.516220
Probe set ID 219039_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000168758
GTEx ID ENSG00000168758

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001126047
ラット[1]  NM_001106902

染色体

2q11.2  [97,525,453  -  97,536,494]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7656991
9464278
10318831
11134026
11162505
11214970
12477932
12975309
15489334
15978582
17498836
20959347
21139048
21890473
22268729
22944267

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0021535  cell migration in hindbrain
GO:0021549  cerebellum development
GO:0042692  muscle cell differentiation
GO:0001843  neural tube closure
GO:0032874  positive regulation of stress-activated MAPK cascade

Cellular Component

GO:0030054  cell junction
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane
GO:0014069  postsynaptic density
GO:0045211  postsynaptic membrane
GO:0030672  synaptic vesicle membrane

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity