slingshot homolog 3 (Drosophila)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

slingshot homolog 3 (Drosophila), FLJ20515, SSH3, FLJ10928, SSH3L, SSH-3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, hSSH-3L, SSH-3L

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:19 小脳:113.30 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:70.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:- 脾臓:113.40 胸腺:51.50 骨髄:59 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:6.40 小脳:6.89 脳幹:6.67 脳梁:6.72 松果体:- 末梢神経:6.25 脊柱:6.74 網膜:- 目:- 動脈:7.03 静脈:6.74 リンパ節:6.60 末梢血:- 脾臓:6.34 胸腺:5.84 骨髄:6.74 脂肪:6.93 骨:- 皮膚:7.07
CAGE 大脳:2.30 小脳:- 脳幹:2.83 脳梁:3.15 松果体:1.82 末梢神経:- 脊柱:2.78 網膜:- 目:- 動脈:3.07 静脈:2.18 リンパ節:2.40 末梢血:- 脾臓:2.10 胸腺:0.91 骨髄:- 脂肪:2.35 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.74 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.20 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:32.80 前立腺:157.70 卵巣:74.50 精巣:13 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:64.80 結腸:8.50     肝臓:21.10        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:50.80 膵臓:8.90 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.78 胎盤:7.29 前立腺:7.19 卵巣:6.81 精巣:5.73 心臓:6.58 骨格筋:5.98 食道:7.63 胃:6.97 腸:6.78 結腸:7.13 肝臓:6.68 肺:6.66 膀胱:- 腎臓:6.81 下垂体:6.83 甲状腺:7.08 副腎:6.69 膵臓:6.41 乳腺:7.41 唾液腺:7.48
CAGE 子宮:2.97 胎盤:3.27 前立腺:3.40 卵巣:3.04 精巣:1.74 心臓:2.31 骨格筋:2.21 食道:3.41 胃:- 腸:2.98 結腸:3.37     肝臓:2.20    肺:2.69 膀胱:3.34 腎臓:2.67 下垂体:2.16 甲状腺:2.90 副腎:- 膵臓:2.60 乳腺:3.06 唾液腺:3.17
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.12 卵巣:3.46 精巣:2.56 心臓:1.52 骨格筋:1.80 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.68     肝臓:1.58        肺:2.79    膀胱:- 腎臓:2.33 下垂体:- 甲状腺:3.12 副腎:2.33 膵臓:- 乳腺:2.62 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_017857
Gene ID 54961
Unigene ID Hs.29173
Probe set ID 219241_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000172830
GTEx ID ENSG00000172830

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_198113
ラット [0]  

染色体

11q13.2  [67,070,919  -  67,080,078]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000340  Dual specificity phosphatase, catalytic domain
IPR020422  Dual specificity phosphatase, subgroup, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
11832213
12477932
14531860
14702039
15489334
15660133
16344560
16964243
17848544
18442045
21832049
21906983

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation
GO:0008064  regulation of actin polymerization or depolymerization
GO:0050770  regulation of axonogenesis
GO:0010591  regulation of lamellipodium assembly

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0004725  protein tyrosine phosphatase activity
GO:0008138  protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity