ceroid-lipofuscinosis, neuronal 6, late infantile, variant

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同義遺伝子名

Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, HsT18960, FLJ20561, CLN6, Protein CLN6

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:9.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:296.70 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:52.90 動脈:- 静脈:133.30 リンパ節:80.90 末梢血:127.50 脾臓:113.40 胸腺:25.80 骨髄:78.70 脂肪:- 骨:38.40 皮膚:62.40
GeneChip 大脳:4.98 小脳:4.97 脳幹:5 脳梁:4.95 松果体:- 末梢神経:4.82 脊柱:4.76 網膜:- 目:- 動脈:5.03 静脈:5.19 リンパ節:5.27 末梢血:- 脾臓:4.94 胸腺:4.82 骨髄:5.49 脂肪:5.16 骨:- 皮膚:5.34
CAGE 大脳:2.64 小脳:- 脳幹:2.82 脳梁:2.99 松果体:4.48 末梢神経:- 脊柱:2.57 網膜:- 目:- 動脈:3.00 静脈:3.03 リンパ節:3.56 末梢血:- 脾臓:3.58 胸腺:3.49 骨髄:- 脂肪:3.39 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.27 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.53 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.77 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:21.90 前立腺:11.30 卵巣:37.30 精巣:17.30 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:84.80     肝臓:21.10        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.79 胎盤:4.76 前立腺:4.75 卵巣:4.90 精巣:5.04 心臓:4.95 骨格筋:5.13 食道:5.10 胃:4.98 腸:5.01 結腸:5.48 肝臓:5.19 肺:5.16 膀胱:- 腎臓:5.32 下垂体:5.12 甲状腺:5.07 副腎:5.16 膵臓:5.29 乳腺:5.16 唾液腺:4.82
CAGE 子宮:3.03 胎盤:3.20 前立腺:2.91 卵巣:2.88 精巣:3.17 心臓:2.68 骨格筋:2.90 食道:2.99 胃:- 腸:3.21 結腸:3.41     肝臓:3.53    肺:3.39 膀胱:2.67 腎臓:3.37 下垂体:1.91 甲状腺:2.86 副腎:- 膵臓:3.32 乳腺:2.64 唾液腺:3.22
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.78 卵巣:2.88 精巣:3.54 心臓:1.71 骨格筋:2.93 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.06     肝臓:2.68        肺:2.12    膀胱:- 腎臓:3.00 下垂体:- 甲状腺:3.35 副腎:3.51 膵臓:- 乳腺:3.08 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_017882
Gene ID 54982
Unigene ID Hs.584921
Probe set ID 218161_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000128973
GTEx ID ENSG00000128973

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001033175
ラット [0]  

染色体

15q23  [68,499,330  -  68,549,444]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9097964
10740217
11722572
11727201
11791207
12477932
12673792
12815591
14702039
15010453
15146197
15265688
15489334
15996215
16303743
16857350
17081983
17453415
18811591
19135028
19201763
19235893
19520283
19946888
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20301334
20301601
21139048
21359198
21549341
21987572
22190034
22883287
23180398
23377640
23455922
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008219  cell death
GO:0044265  cellular macromolecule catabolic process
GO:0008203  cholesterol metabolic process
GO:0001573  ganglioside metabolic process
GO:0030203  glycosaminoglycan metabolic process
GO:0031987  locomotion involved in locomotory behavior
GO:0007042  lysosomal lumen acidification
GO:0045862  positive regulation of proteolysis
GO:0030163  protein catabolic process
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0005789  endoplasmic reticulum membrane
GO:0016021  integral to membrane

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0042803  protein homodimerization activity