membrane-associated ring finger (C3HC4) 1

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同義遺伝子名

membrane-associated ring finger (C3HC4) 1, MARCH-I, MARCH1, DKFZp564M1682, RNF171, FLJ20668

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.55 小脳:3.51 脳幹:4.82 脳梁:5.16 松果体:- 末梢神経:4.27 脊柱:4.48 網膜:- 目:- 動脈:3.75 静脈:3.60 リンパ節:5.41 末梢血:- 脾臓:5.67 胸腺:4.51 骨髄:4.19 脂肪:3.95 骨:- 皮膚:3.77
CAGE 大脳:3.77 小脳:- 脳幹:4.18 脳梁:4.21 松果体:4.79 末梢神経:- 脊柱:4.44 網膜:- 目:- 動脈:2.34 静脈:3.88 リンパ節:3.84 末梢血:- 脾臓:4.44 胸腺:2.07 骨髄:- 脂肪:3.16 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.72 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.92 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.32 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.64 胎盤:3.84 前立腺:3.78 卵巣:3.81 精巣:3.40 心臓:3.81 骨格筋:3.62 食道:3.61 胃:3.68 腸:3.67 結腸:3.70 肝臓:3.78 肺:3.98 膀胱:- 腎臓:3.56 下垂体:4.12 甲状腺:3.73 副腎:3.80 膵臓:4.05 乳腺:3.70 唾液腺:3.54
CAGE 子宮:1.66 胎盤:2.54 前立腺:2.20 卵巣:2.01 精巣:1.61 心臓:1.67 骨格筋:1.02 食道:2.21 胃:- 腸:2.14 結腸:1.92     肝臓:2.05    肺:3.26 膀胱:2.72 腎臓:2.29 下垂体:3.40 甲状腺:1.05 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:1.80 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.22 卵巣:1.32 精巣:1.11 心臓:0.87 骨格筋:0.37 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.54     肝臓:0.94        肺:1.52    膀胱:- 腎臓:1.12 下垂体:- 甲状腺:0.94 副腎:3.11 膵臓:- 乳腺:1.10 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_017923
Gene ID 55016
Unigene ID Hs.608487
Probe set ID 219574_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000145416
GTEx ID ENSG00000145416

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_001166372, NM_001166375, NM_175188
ラット[1]  NM_001135838, NM_001166375, NM_175188

染色体

4q32.3  [164,445,450  -  165,305,202]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR018957  Zinc finger, C3HC4 RING-type
IPR011016  Zinc finger, RING-CH-type
IPR013083  Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9847074
14702039
14722266
17540176
18305173
18389477
19117940
20379614
21490949
21757542
21896490
22508929
23264739
23400868
23606747

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0002495  antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II
GO:0006955  immune response
GO:0000209  protein polyubiquitination

Cellular Component

GO:0030659  cytoplasmic vesicle membrane
GO:0031901  early endosome membrane
GO:0005789  endoplasmic reticulum membrane
GO:0005768  endosome
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0016021  integral to membrane
GO:0031902  late endosome membrane
GO:0005765  lysosomal membrane
GO:0005764  lysosome
GO:0005886  plasma membrane
GO:0032588  trans-Golgi network membrane

Molecular Function

GO:0042287  MHC protein binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding