ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

ATG16L, UNQ9393/PRO34307, WDR30, ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, APG16L, FLJ00045, ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae), FLJ10035, FLJ10828, ATG16 autophagy related 16-like (S. cerevisiae), APG16-like 1, FLJ22677, APG16 autophagy 16-like (S. cerevisiae)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:100.70

小脳:100.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:-

目:47

動脈:30

静脈:-

リンパ節:80.90

末梢血:36.40

脾臓:18.90

胸腺:180.40

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:64

皮膚:14.40

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.15

小脳:-

脳幹:3.01

脳梁:3.14

松果体:2.63

末梢神経:-

脊柱:2.69

網膜:-

目:-

動脈:2.84

静脈:2.94

リンパ節:2.90

末梢血:-

脾臓:2.55

胸腺:2.96

骨髄:-

脂肪:2.63

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.67

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.16

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.63

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:40.10

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:90.90

心臓:63.90

骨格筋:-

食道:-

胃:63.70

腸:64.80

結腸:152.60

肝臓:63.30

肺:73.30

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:927.90

甲状腺:163.70

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:74.30

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:2.87

胎盤:2.64

前立腺:2.87

卵巣:2.48

精巣:2.99

心臓:2.64

骨格筋:2.66

食道:2.60

胃:-

腸:2.94

結腸:2.99

肝臓:2.66

肺:2.68

膀胱:2.79

腎臓:2.64

下垂体:2.54

甲状腺:2.86

副腎:-

膵臓:2.90

乳腺:2.74

唾液腺:2.97

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.97

卵巣:0.56

精巣:2.45

心臓:1.17

骨格筋:0.60

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.78

肝臓:1.86

肺:0.44

膀胱:-

腎臓:1.06

下垂体:-

甲状腺:3.05

副腎:0.52

膵臓:-

乳腺:0.37

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_017974
Gene ID	55054
Unigene ID	Hs.529322
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000085978
GTEx ID	ENSG00000085978

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001205391, NM_001205392, NM_029846
ラット[1]	NM_001108809, NM_001205392, NM_029846

染色体

2q37.1 [234,118,697 - 234,204,320]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472	G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000045	autophagic vacuole formation
GO:0051260	protein homooligomerization
GO:0015031	protein transport

Cellular Component

GO:0005776	autophagic vacuole
GO:0000421	autophagic vacuole membrane
GO:0034045	pre-autophagosomal structure membrane

Molecular Function

GO:0005515

protein binding

ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function