S1 RNA binding domain 1

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同義遺伝子名

SRBD1, S1 RNA binding domain 1, FLJ10379

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:19

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:17.60

動脈:30

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:36.40

脾臓:56.70

胸腺:25.80

骨髄:59

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:4.98

小脳:4.90

脳幹:5.18

脳梁:5.11

松果体:-

末梢神経:5.58

脊柱:5.42

網膜:-

目:-

動脈:5.42

静脈:5.42

リンパ節:5.80

末梢血:-

脾臓:5.85

胸腺:6.14

骨髄:5.81

脂肪:5.43

骨:-

皮膚:5.14

CAGE

大脳:2.13

小脳:-

脳幹:2.56

脳梁:2.40

松果体:2.91

末梢神経:-

脊柱:2.58

網膜:-

目:-

動脈:2.17

静脈:2.74

リンパ節:2.98

末梢血:-

脾臓:3.24

胸腺:3.21

骨髄:-

脂肪:2.95

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.96

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.99

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.06

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:25.50

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:90.90

心臓:-

骨格筋:40.20

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:76.30

肝臓:42.20

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:116

甲状腺:327.50

副腎:50.80

膵臓:44.50

乳腺:111.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.76

胎盤:5.17

前立腺:5.90

卵巣:5.51

精巣:6.01

心臓:5.34

骨格筋:5.15

食道:5.29

胃:5.64

腸:5.24

結腸:5.05

肝臓:5.58

肺:5.49

膀胱:-

腎臓:5.34

下垂体:6.02

甲状腺:5.92

副腎:5.52

膵臓:5.42

乳腺:5.76

唾液腺:5.62

CAGE

子宮:3.31

胎盤:2.79

前立腺:3.04

卵巣:2.82

精巣:2.98

心臓:2.52

骨格筋:2.55

食道:2.58

胃:-

腸:2.99

結腸:2.31

肝臓:2.86

肺:2.96

膀胱:2.78

腎臓:2.80

下垂体:3.40

甲状腺:2.68

副腎:-

膵臓:2.94

乳腺:1.92

唾液腺:2.75

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.46

卵巣:2.42

精巣:3.57

心臓:1.75

骨格筋:1.68

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.65

肝臓:1.99

肺:1.88

膀胱:-

腎臓:2.14

下垂体:-

甲状腺:3.05

副腎:2.13

膵臓:-

乳腺:2.05

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_018079
Gene ID	55133
Unigene ID	Hs.14229
Probe set ID	219055_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000068784
GTEx ID	ENSG00000068784

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_030133
ラット[1]	NM_030133

染色体

2p21 [45,615,819 - 45,839,304]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR012340	Nucleic acid-binding, OB-fold
IPR016027	Nucleic acid-binding, OB-fold-like
IPR003029	Ribosomal protein S1, RNA binding domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

9847074
12477932
14702039
16344560
19240061
19322201
19471022
19615732
20020773
20363506
20379614
21139048
21282530
22174317
22939629
24040232
24163370
24332808
24816145

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolic process

Molecular Function

GO:0016788	hydrolase activity, acting on ester bonds
GO:0003723	RNA binding