trimethyllysine hydroxylase, epsilon

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同義遺伝子名

FLJ10727, BBOX2, XAP130, Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase, TMLD, TMLH, trimethyllysine hydroxylase, epsilon, TML dioxygenase, TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase, TMLHE, TML hydroxylase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:23.70 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:38.70 骨髄:98.40 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:4.40 小脳:4.45 脳幹:4.36 脳梁:4.46 松果体:- 末梢神経:4.33 脊柱:4.64 網膜:- 目:- 動脈:4.30 静脈:4.35 リンパ節:4.04 末梢血:- 脾臓:4.05 胸腺:3.95 骨髄:4.36 脂肪:4.31 骨:- 皮膚:4.17
CAGE 大脳:2.29 小脳:- 脳幹:2.33 脳梁:2.21 松果体:2.57 末梢神経:- 脊柱:2.30 網膜:- 目:- 動脈:2.28 静脈:2.01 リンパ節:2.33 末梢血:- 脾臓:2.06 胸腺:2.22 骨髄:- 脂肪:1.84 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.23 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.89 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.49 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:14.60 前立腺:11.30 卵巣:74.50 精巣:8.70 心臓:- 骨格筋:40.20 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:17     肝臓:10.60        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.18 胎盤:4.12 前立腺:4.04 卵巣:4.16 精巣:3.91 心臓:4.60 骨格筋:4.84 食道:4.27 胃:4.23 腸:4.49 結腸:4.26 肝臓:4.42 肺:4.03 膀胱:- 腎臓:4.44 下垂体:4.32 甲状腺:4.10 副腎:4.32 膵臓:4.35 乳腺:3.97 唾液腺:4.43
CAGE 子宮:2.22 胎盤:1.91 前立腺:2.10 卵巣:2.44 精巣:1.37 心臓:2.49 骨格筋:1.63 食道:2.12 胃:- 腸:2.16 結腸:2.48     肝臓:2.15    肺:1.64 膀胱:1.95 腎臓:2.06 下垂体:2.41 甲状腺:2.25 副腎:- 膵臓:2.18 乳腺:2.27 唾液腺:2.69
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.05 卵巣:2.15 精巣:1.11 心臓:2.28 骨格筋:2.67 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.88     肝臓:1.61        肺:0.82    膀胱:- 腎臓:1.62 下垂体:- 甲状腺:1.38 副腎:0.82 膵臓:- 乳腺:1.76 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018196
Gene ID 55217
Unigene ID Hs.133321
Probe set ID 218790_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000185973
GTEx ID ENSG00000185973

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_138758
ラット[1]  NM_133387

染色体

Xq28  [154,719,776  -  154,899,605]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003819  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA
IPR012776  Trimethyllysine dioxygenase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8908511
11076863
11256614
11431483
12477932
14702039
15489334
15489336
15754339
15772651
16344560
16381901
17408883
21865298
21890473
22566635
23092983
24654937

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045329  carnitine biosynthetic process
GO:0034641  cellular nitrogen compound metabolic process
GO:0051354  negative regulation of oxidoreductase activity

Cellular Component

GO:0005759  mitochondrial matrix
GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0005506  iron ion binding
GO:0031418  L-ascorbic acid binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0050353  trimethyllysine dioxygenase activity