paraspeckle component 1

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同義遺伝子名

PSPC1, FLJ10955, PSP1, DKFZp566B1447, paraspeckle component 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:86.50

小脳:63

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:593.40

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:237.30

目:99.90

動脈:119.90

静脈:-

リンパ節:273

末梢血:72.90

脾臓:75.60

胸腺:154.60

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:64

皮膚:134.40

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.68

小脳:-

脳幹:3.52

脳梁:3.66

松果体:3.95

末梢神経:-

脊柱:3.40

網膜:-

目:-

動脈:3.50

静脈:3.71

リンパ節:3.82

末梢血:-

脾臓:3.53

胸腺:4.02

骨髄:-

脂肪:3.18

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.67

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.71

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.25

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:131.10

前立腺:90.10

卵巣:37.30

精巣:116.80

心臓:63.90

骨格筋:-

食道:342.80

胃:169.90

腸:259.20

結腸:135.70

肝臓:42.20

肺:68.40

膀胱:125.60

腎臓:166.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:44.50

乳腺:139.40

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.68

胎盤:4.05

前立腺:3.37

卵巣:3.53

精巣:4.00

心臓:3.19

骨格筋:3.44

食道:2.92

胃:-

腸:3.42

結腸:3.27

肝臓:2.82

肺:3.34

膀胱:3.35

腎臓:3.33

下垂体:3.87

甲状腺:3.07

副腎:-

膵臓:3.10

乳腺:3.40

唾液腺:3.35

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.17

卵巣:4.16

精巣:4.00

心臓:2.48

骨格筋:3.14

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.04

肝臓:1.94

肺:1.25

膀胱:-

腎臓:2.98

下垂体:-

甲状腺:4.37

副腎:3.53

膵臓:-

乳腺:2.57

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001042414
Gene ID	55269
Unigene ID	Hs.213198
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000121390
GTEx ID	ENSG00000121390

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_025682
ラット[1]	NM_001025672

染色体

13q12.11 [20,248,896 - 20,357,142]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0042382	paraspeckles

Molecular Function

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding